23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0203 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0203  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  225  1e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.265477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1028  hypothetical protein  42.37 
 
 		 121 aa  108  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.771567  normal  0.685369 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3586  hypothetical protein  41.38 
 
 		 122 aa  90.9  6e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0216464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3788  hypothetical protein  42.11 
 
 		 133 aa  87  8e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.149286  hitchhiker  0.00561497 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3884  phosphoribosylanthranilate isomerase-like protein  45.26 
 
 		 126 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.852598  normal  0.497683 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3588  hypothetical protein  38.83 
 
 		 132 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3273  hypothetical protein  38.83 
 
 		 126 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.343272 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2927  hypothetical protein  31.58 
 
 		 98 aa  51.6  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.142227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0164  hypothetical protein  36.9 
 
 		 107 aa  51.2  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0152  hypothetical protein  31.48 
 
 		 107 aa  50.4  0.000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0022  hypothetical protein  30.84 
 
 		 114 aa  50.1  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00013194 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2502  hypothetical protein  38.96 
 
 		 112 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.246451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0147  hypothetical protein  30.56 
 
 		 107 aa  47.4  0.00006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.264223  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2443  hypothetical protein  28.04 
 
 		 122 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0394  hypothetical protein  35.06 
 
 		 130 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.906344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2199  hypothetical protein  34.29 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.983186  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0178  hypothetical protein  32.56 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0120  hypothetical protein  32.56 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.598162  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0058  hypothetical protein  28.87 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.772862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0065  hypothetical protein  30.21 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0042  hypothetical protein  27.84 
 
 		 110 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.260618 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0203  hypothetical protein  30.23 
 
 		 122 aa  41.6  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.164325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0057  hypothetical protein  27.84 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0688215  normal  0.189788 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>