22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1028 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1028  hypothetical protein  100 
 
 		 121 aa  244  2e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.771567  normal  0.685369 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3884  phosphoribosylanthranilate isomerase-like protein  49.51 
 
 		 126 aa  101  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.852598  normal  0.497683 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3588  hypothetical protein  49.51 
 
 		 132 aa  100  5e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3273  hypothetical protein  49.51 
 
 		 126 aa  100  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.343272 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0203  hypothetical protein  42.37 
 
 		 116 aa  93.6  8e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.265477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3788  hypothetical protein  36.21 
 
 		 133 aa  85.1  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.149286  hitchhiker  0.00561497 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3586  hypothetical protein  41.41 
 
 		 122 aa  78.6  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0216464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2443  hypothetical protein  34.34 
 
 		 122 aa  57  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0178  hypothetical protein  35.92 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0120  hypothetical protein  35.92 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.598162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0203  hypothetical protein  36.89 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.164325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0164  hypothetical protein  33.71 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0022  hypothetical protein  30.3 
 
 		 114 aa  48.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00013194 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2502  hypothetical protein  39.02 
 
 		 112 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.246451  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0152  hypothetical protein  31 
 
 		 107 aa  47  0.00009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2927  hypothetical protein  32.93 
 
 		 98 aa  46.2  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.142227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2199  hypothetical protein  34.21 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.983186  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0065  hypothetical protein  31 
 
 		 115 aa  45.4  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0042  hypothetical protein  30.3 
 
 		 110 aa  44.3  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.260618 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0147  hypothetical protein  30 
 
 		 107 aa  43.9  0.0008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.264223  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0394  hypothetical protein  34.62 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.906344  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0058  hypothetical protein  29.29 
 
 		 110 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.772862  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>