31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2443 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2443  hypothetical protein  100 
 
 
122 aa  241  3e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0120  hypothetical protein  59.52 
 
 
122 aa  121  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.598162  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0178  hypothetical protein  59.52 
 
 
122 aa  120  5e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0203  hypothetical protein  61.98 
 
 
122 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.164325  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2199  hypothetical protein  53.72 
 
 
112 aa  100  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.983186  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2502  hypothetical protein  59.38 
 
 
112 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.246451  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0164  hypothetical protein  45.05 
 
 
107 aa  85.5  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0022  hypothetical protein  38.18 
 
 
114 aa  81.3  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00013194 
 
 
-
 
NC_004310  BR0152  hypothetical protein  47.06 
 
 
107 aa  80.5  0.000000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0042  hypothetical protein  38.38 
 
 
110 aa  78.2  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.260618 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0394  hypothetical protein  40.21 
 
 
130 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.906344  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0147  hypothetical protein  45.88 
 
 
107 aa  77.8  0.00000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.264223  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0058  hypothetical protein  38.38 
 
 
110 aa  77  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.772862  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0070  hypothetical protein  39.18 
 
 
128 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0131159  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2218  hypothetical protein  51.39 
 
 
106 aa  76.3  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102772  normal  0.371224 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0637  hypothetical protein  42.27 
 
 
138 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0609514 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0065  hypothetical protein  36.19 
 
 
115 aa  73.6  0.0000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0411  hypothetical protein  36.54 
 
 
116 aa  72  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0195  hypothetical protein  40.21 
 
 
137 aa  70.5  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119963  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0057  hypothetical protein  34.29 
 
 
115 aa  70.1  0.000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0688215  normal  0.189788 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2927  hypothetical protein  40 
 
 
98 aa  66.2  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.142227  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0146  hypothetical protein  36.27 
 
 
95 aa  62  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0099  hypothetical protein  38.04 
 
 
130 aa  60.8  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3588  hypothetical protein  33.61 
 
 
132 aa  57  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1028  hypothetical protein  34.34 
 
 
121 aa  57  0.00000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.771567  normal  0.685369 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3884  phosphoribosylanthranilate isomerase-like protein  31.93 
 
 
126 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.852598  normal  0.497683 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0145  hypothetical protein  43.06 
 
 
108 aa  55.8  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3673  hypothetical protein  42.19 
 
 
107 aa  55.1  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3273  hypothetical protein  32.77 
 
 
126 aa  55.1  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.343272 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3788  hypothetical protein  26.87 
 
 
133 aa  43.9  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.149286  hitchhiker  0.00561497 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3586  hypothetical protein  27.93 
 
 
122 aa  42.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0216464  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>