32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0120 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0120  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  238  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.598162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0178  hypothetical protein  99.18 
 
 		 122 aa  237  4e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0203  hypothetical protein  88.52 
 
 		 122 aa  201  3e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.164325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2443  hypothetical protein  59.52 
 
 		 122 aa  136  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2199  hypothetical protein  57.02 
 
 		 112 aa  106  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.983186  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2502  hypothetical protein  59.5 
 
 		 112 aa  101  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.246451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0070  hypothetical protein  39.17 
 
 		 128 aa  79.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0131159  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0164  hypothetical protein  34.31 
 
 		 107 aa  75.5  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0152  hypothetical protein  37.37 
 
 		 107 aa  75.1  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0065  hypothetical protein  35.05 
 
 		 115 aa  74.3  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0057  hypothetical protein  36.08 
 
 		 115 aa  73.9  0.0000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0688215  normal  0.189788 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0394  hypothetical protein  37.5 
 
 		 130 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.906344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2218  hypothetical protein  54.93 
 
 		 106 aa  73.6  0.0000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102772  normal  0.371224 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0042  hypothetical protein  36.84 
 
 		 110 aa  72.8  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.260618 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0147  hypothetical protein  36.36 
 
 		 107 aa  72.4  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.264223  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0411  hypothetical protein  34.19 
 
 		 116 aa  70.9  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0058  hypothetical protein  35.79 
 
 		 110 aa  70.9  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.772862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0022  hypothetical protein  31.58 
 
 		 114 aa  68.6  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00013194 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0195  hypothetical protein  38.54 
 
 		 137 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0146  hypothetical protein  41.38 
 
 		 95 aa  66.2  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0637  hypothetical protein  37.5 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0609514 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1028  hypothetical protein  33.6 
 
 		 121 aa  62  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.771567  normal  0.685369 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2927  hypothetical protein  36.17 
 
 		 98 aa  62.4  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.142227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0099  hypothetical protein  41.67 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0145  hypothetical protein  47.14 
 
 		 108 aa  59.3  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3788  hypothetical protein  28.79 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.149286  hitchhiker  0.00561497 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3588  hypothetical protein  31.75 
 
 		 132 aa  52  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3273  hypothetical protein  31.75 
 
 		 126 aa  51.6  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.343272 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3884  phosphoribosylanthranilate isomerase-like protein  33.98 
 
 		 126 aa  50.8  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.852598  normal  0.497683 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3586  hypothetical protein  35.35 
 
 		 122 aa  49.7  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0216464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3673  hypothetical protein  36.92 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0203  hypothetical protein  31.46 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.265477  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>