25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3884 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3884  phosphoribosylanthranilate isomerase-like protein  100 
 
 		 126 aa  252  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.852598  normal  0.497683 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3273  hypothetical protein  91.27 
 
 		 126 aa  210  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.343272 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3588  hypothetical protein  90.48 
 
 		 132 aa  209  1e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1028  hypothetical protein  48 
 
 		 121 aa  120  8e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.771567  normal  0.685369 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3788  hypothetical protein  41.13 
 
 		 133 aa  96.3  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.149286  hitchhiker  0.00561497 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0203  hypothetical protein  40.78 
 
 		 116 aa  75.1  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.265477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2443  hypothetical protein  33.6 
 
 		 122 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3586  hypothetical protein  32.67 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0216464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2199  hypothetical protein  34.48 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.983186  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2502  hypothetical protein  35.34 
 
 		 112 aa  57  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.246451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0120  hypothetical protein  33.98 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.598162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0178  hypothetical protein  31.75 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0203  hypothetical protein  33.98 
 
 		 122 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.164325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0394  hypothetical protein  28 
 
 		 130 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.906344  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0152  hypothetical protein  30.28 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2218  hypothetical protein  31.03 
 
 		 106 aa  48.9  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102772  normal  0.371224 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2927  hypothetical protein  29.9 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.142227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0147  hypothetical protein  29.36 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.264223  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0042  hypothetical protein  30 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.260618 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0164  hypothetical protein  29.36 
 
 		 107 aa  45.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0022  hypothetical protein  26.5 
 
 		 114 aa  46.2  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00013194 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0058  hypothetical protein  28 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.772862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0057  hypothetical protein  26.09 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0688215  normal  0.189788 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0411  hypothetical protein  28.7 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1463  hypothetical protein  28.16 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>