21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3788 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3788  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  260  4.999999999999999e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.149286  hitchhiker  0.00561497 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1028  hypothetical protein  36.21 
 
 		 121 aa  85.1  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.771567  normal  0.685369 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3273  hypothetical protein  41.13 
 
 		 126 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.343272 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3588  hypothetical protein  41.94 
 
 		 132 aa  77  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3884  phosphoribosylanthranilate isomerase-like protein  39.22 
 
 		 126 aa  77  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.852598  normal  0.497683 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0203  hypothetical protein  42.11 
 
 		 116 aa  74.3  0.0000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.265477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3586  hypothetical protein  35.87 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0216464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0022  hypothetical protein  29.85 
 
 		 114 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00013194 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2927  hypothetical protein  37.5 
 
 		 98 aa  52.4  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.142227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0394  hypothetical protein  35.96 
 
 		 130 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.906344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0057  hypothetical protein  30.85 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0688215  normal  0.189788 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0065  hypothetical protein  35.23 
 
 		 115 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2199  hypothetical protein  33.33 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.983186  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0178  hypothetical protein  28.18 
 
 		 122 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2502  hypothetical protein  31.71 
 
 		 112 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.246451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2443  hypothetical protein  26.87 
 
 		 122 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0120  hypothetical protein  27.27 
 
 		 122 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.598162  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0152  hypothetical protein  27.52 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0195  hypothetical protein  34.04 
 
 		 137 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3673  hypothetical protein  29.69 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0203  hypothetical protein  25.45 
 
 		 122 aa  40.4  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.164325  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>