27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0195 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0195  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  274  4e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0637  hypothetical protein  86.23 
 
 		 138 aa  205  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0609514 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0070  hypothetical protein  72.66 
 
 		 128 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0131159  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0394  hypothetical protein  68.46 
 
 		 130 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.906344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0065  hypothetical protein  61.86 
 
 		 115 aa  130  7.999999999999999e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0057  hypothetical protein  61.86 
 
 		 115 aa  126  9.000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0688215  normal  0.189788 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0099  hypothetical protein  56.9 
 
 		 130 aa  93.6  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2443  hypothetical protein  40.21 
 
 		 122 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0058  hypothetical protein  43.33 
 
 		 110 aa  78.2  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.772862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0022  hypothetical protein  37.93 
 
 		 114 aa  78.2  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00013194 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0042  hypothetical protein  41.11 
 
 		 110 aa  74.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.260618 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2927  hypothetical protein  43.48 
 
 		 98 aa  73.2  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.142227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0203  hypothetical protein  41.53 
 
 		 122 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.164325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0120  hypothetical protein  38.54 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.598162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0178  hypothetical protein  38.54 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0152  hypothetical protein  36.9 
 
 		 107 aa  70.1  0.000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0147  hypothetical protein  35.71 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.264223  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0164  hypothetical protein  36.9 
 
 		 107 aa  66.2  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0411  hypothetical protein  34.29 
 
 		 116 aa  66.2  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2218  hypothetical protein  43.66 
 
 		 106 aa  66.2  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102772  normal  0.371224 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2199  hypothetical protein  36.46 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.983186  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3673  hypothetical protein  42.62 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0146  hypothetical protein  34.57 
 
 		 95 aa  55.1  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2502  hypothetical protein  32.5 
 
 		 112 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.246451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3788  hypothetical protein  34.04 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.149286  hitchhiker  0.00561497 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0145  hypothetical protein  36.49 
 
 		 108 aa  47.4  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1028  hypothetical protein  28.44 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.771567  normal  0.685369 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>