31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0637 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0637  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  277  4e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0609514 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0195  hypothetical protein  86.23 
 
 		 137 aa  204  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0070  hypothetical protein  72.09 
 
 		 128 aa  165  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0131159  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0394  hypothetical protein  66.92 
 
 		 130 aa  164  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.906344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0065  hypothetical protein  64.95 
 
 		 115 aa  138  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0057  hypothetical protein  60.82 
 
 		 115 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0688215  normal  0.189788 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0099  hypothetical protein  54.7 
 
 		 130 aa  90.9  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2443  hypothetical protein  42.27 
 
 		 122 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2927  hypothetical protein  43.48 
 
 		 98 aa  78.6  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.142227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0022  hypothetical protein  37.93 
 
 		 114 aa  78.6  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00013194 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0058  hypothetical protein  42.22 
 
 		 110 aa  76.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.772862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0042  hypothetical protein  42.35 
 
 		 110 aa  72.4  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.260618 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0203  hypothetical protein  40.62 
 
 		 122 aa  67  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.164325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0120  hypothetical protein  37.5 
 
 		 122 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.598162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0178  hypothetical protein  37.5 
 
 		 122 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0152  hypothetical protein  34.52 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0411  hypothetical protein  33.33 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0164  hypothetical protein  34.52 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0147  hypothetical protein  33.33 
 
 		 107 aa  62.8  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.264223  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2218  hypothetical protein  42.25 
 
 		 106 aa  62.4  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102772  normal  0.371224 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2199  hypothetical protein  35.42 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.983186  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3673  hypothetical protein  40.98 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0146  hypothetical protein  34.57 
 
 		 95 aa  53.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2502  hypothetical protein  29.11 
 
 		 112 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.246451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3788  hypothetical protein  29.03 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.149286  hitchhiker  0.00561497 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0145  hypothetical protein  33.8 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1028  hypothetical protein  26.61 
 
 		 121 aa  45.4  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.771567  normal  0.685369 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0203  hypothetical protein  30.26 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.265477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1372  hypothetical protein  30.3 
 
 		 83 aa  40.8  0.007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0055  hypothetical protein  33.33 
 
 		 81 aa  40.4  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0548  hypothetical protein  33.33 
 
 		 81 aa  40  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>