30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3673 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3673  hypothetical protein  100 
 
 
107 aa  208  2e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0152  hypothetical protein  55.06 
 
 
107 aa  108  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0147  hypothetical protein  53.26 
 
 
107 aa  105  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.264223  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0164  hypothetical protein  50.55 
 
 
107 aa  102  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0022  hypothetical protein  37.38 
 
 
114 aa  87  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00013194 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0042  hypothetical protein  45.88 
 
 
110 aa  83.6  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.260618 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0058  hypothetical protein  45.88 
 
 
110 aa  83.2  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.772862  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0394  hypothetical protein  42.86 
 
 
130 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.906344  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2927  hypothetical protein  45.35 
 
 
98 aa  75.9  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.142227  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0411  hypothetical protein  38.55 
 
 
116 aa  72.8  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2218  hypothetical protein  44.33 
 
 
106 aa  72.8  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102772  normal  0.371224 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2443  hypothetical protein  41.41 
 
 
122 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0065  hypothetical protein  38.55 
 
 
115 aa  68.6  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2199  hypothetical protein  40.24 
 
 
112 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.983186  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0070  hypothetical protein  40.85 
 
 
128 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0131159  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0057  hypothetical protein  37.35 
 
 
115 aa  64.3  0.0000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0688215  normal  0.189788 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2502  hypothetical protein  36.36 
 
 
112 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.246451  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1372  hypothetical protein  34.33 
 
 
83 aa  59.3  0.00000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0195  hypothetical protein  41.18 
 
 
137 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.119963  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0637  hypothetical protein  39.13 
 
 
138 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0609514 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0146  hypothetical protein  30.43 
 
 
95 aa  57.8  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0178  hypothetical protein  39.53 
 
 
122 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0120  hypothetical protein  39.53 
 
 
122 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.598162  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3788  hypothetical protein  32.61 
 
 
133 aa  52.4  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.149286  hitchhiker  0.00561497 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0099  hypothetical protein  46.15 
 
 
130 aa  51.2  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0203  hypothetical protein  38.37 
 
 
122 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.164325  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0145  hypothetical protein  40.32 
 
 
108 aa  47  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1028  hypothetical protein  30 
 
 
121 aa  41.2  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.771567  normal  0.685369 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3588  hypothetical protein  28.85 
 
 
132 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3273  hypothetical protein  28.85 
 
 
126 aa  40  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.343272 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>