More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4727 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4727  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  100 
 
 		 230 aa  468  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1631  HAD family hydrolase  74.89 
 
 		 230 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.318646  normal  0.223643 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5016  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  73.09 
 
 		 230 aa  289  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0704684  normal  0.049198 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5788  HAD family hydrolase  67.26 
 
 		 227 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.438539 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3047  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  65.44 
 
 		 226 aa  280  1e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5978  HAD family hydrolase  62.9 
 
 		 230 aa  278  4e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.367832 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0330  HAD family hydrolase  65.44 
 
 		 225 aa  278  5e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.438813 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2077  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  64.76 
 
 		 231 aa  266  2e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0155497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3773  HAD family hydrolase  62.67 
 
 		 220 aa  236  2e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0467  HAD family hydrolase  61.82 
 
 		 219 aa  235  4e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.530029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0122  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  52.49 
 
 		 229 aa  212  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0130  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  52.05 
 
 		 232 aa  209  3e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4360  HAD family hydrolase  65.91 
 
 		 241 aa  206  3e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0110  HAD family hydrolase  51.57 
 
 		 227 aa  205  4e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0271  hypothetical protein  50.68 
 
 		 229 aa  202  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.586518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0142  HAD family hydrolase  50.45 
 
 		 235 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0085  HAD family hydrolase  45 
 
 		 228 aa  170  2e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0109  HAD family hydrolase  38.29 
 
 		 223 aa  158  7e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00453013 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0045  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  37.61 
 
 		 232 aa  141  7e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal  0.617373 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0996  HAD family hydrolase  38.12 
 
 		 219 aa  141  8e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0106068 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2179  HAD family hydrolase  40 
 
 		 223 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.812633 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5789  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  37.79 
 
 		 248 aa  132  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.805096 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0698  HAD-superfamily hydrolase  41.99 
 
 		 232 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2542  HAD family hydrolase  35.91 
 
 		 214 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.214098 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2352  HAD family hydrolase  38.03 
 
 		 222 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00492029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0610  HAD family hydrolase  36.24 
 
 		 260 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5021  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.57 
 
 		 223 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.886555  normal  0.11436 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07310  putative hydrolase  38.39 
 
 		 224 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.642028  normal  0.985429 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0336  HAD-superfamily hydrolase  40.72 
 
 		 232 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.438572  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1038  HAD-superfamily hydrolase  40.69 
 
 		 232 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0634  HAD-superfamily hydrolase  40.72 
 
 		 232 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.535941  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1142  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.18 
 
 		 231 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.513371  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2468  HAD-superfamily hydrolase  40.72 
 
 		 232 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.273983  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0082  HAD family hydrolase  40.72 
 
 		 232 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0196618  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0879  HAD family hydrolase  40.69 
 
 		 232 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0467  HAD family hydrolase  35.48 
 
 		 219 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.577769 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4948  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.24 
 
 		 223 aa  126  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0909  HAD superfamily hydrolase  36.87 
 
 		 223 aa  126  3e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1543  HAD family hydrolase  36.87 
 
 		 218 aa  126  3e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.290377 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0243  HAD family hydrolase  36.62 
 
 		 217 aa  126  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3783  HAD family hydrolase  37.04 
 
 		 242 aa  126  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0711244  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0665  haloacid dehalogenase, IA family protein  37.5 
 
 		 231 aa  125  5e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.233376  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0969  HAD superfamily hydrolase  36.87 
 
 		 223 aa  125  5e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.512298  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0959  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3 family protein  35.02 
 
 		 216 aa  124  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0734377  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0875  HAD family hydrolase  40.69 
 
 		 232 aa  122  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0589  HAD family hydrolase  38.64 
 
 		 217 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2561  HAD family hydrolase  41.28 
 
 		 214 aa  122  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.467395  normal  0.978444 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2741  HAD family hydrolase  35 
 
 		 240 aa  122  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5532  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.17 
 
 		 214 aa  122  6e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0902  hydrolase, haloacid dehalogenase-like hydrolase  41.28 
 
 		 214 aa  122  7e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6015  HAD family hydrolase  35.16 
 
 		 228 aa  121  7e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4184  HAD family hydrolase  32.41 
 
 		 212 aa  121  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1080  hypothetical protein  35.14 
 
 		 229 aa  121  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0442  HAD family hydrolase  33.49 
 
 		 218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2605  HAD family hydrolase  34.55 
 
 		 240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2303  HAD family hydrolase  35.78 
 
 		 230 aa  119  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.432343  normal  0.0684019 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0723  HAD family hydrolase  39.38 
 
 		 240 aa  119  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.272248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0762  HAD family hydrolase  37 
 
 		 229 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0418  HAD family hydrolase  34.4 
 
 		 228 aa  118  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.513093 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2473  HAD family hydrolase  35.48 
 
 		 230 aa  118  7e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0237734  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3493  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.63 
 
 		 228 aa  118  7e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.292984 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2076  HAD family hydrolase  34.7 
 
 		 244 aa  118  7e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140944  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2687  HAD family hydrolase  34.7 
 
 		 244 aa  118  7e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0636  HAD family hydrolase  35.71 
 
 		 252 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2716  HAD family hydrolase  33.94 
 
 		 228 aa  118  9e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0596  HAD-superfamily hydrolase  34.55 
 
 		 240 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0603  HAD family hydrolase  33.18 
 
 		 230 aa  116  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.432882  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4509  HAD family hydrolase  34.55 
 
 		 225 aa  115  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2508  HAD family hydrolase  38.01 
 
 		 237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.076946  normal  0.415446 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1330  HAD family hydrolase  39.82 
 
 		 230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0637  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.82 
 
 		 229 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.872179  normal  0.213307 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4216  6-phosphogluconate phosphatase  33.94 
 
 		 223 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1982  HAD family hydrolase  38.18 
 
 		 237 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.118092  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2616  HAD family hydrolase  38.74 
 
 		 237 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.973469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1388  HAD family hydrolase  34.26 
 
 		 223 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2592  HAD family hydrolase  38.18 
 
 		 237 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.119238  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3243  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.73 
 
 		 237 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0124526  normal  0.9958 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3323  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.4 
 
 		 228 aa  113  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.866957  normal  0.157588 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0896  HAD-superfamily hydrolase  34.4 
 
 		 228 aa  112  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4181  haloacid dehalogenase-like hydrolase  66.67 
 
 		 99 aa  112  6e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.66908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0716  haloacid dehalogenase, IA family protein  34.4 
 
 		 228 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0231  HAD-superfamily hydrolase  34.4 
 
 		 228 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2443  HAD-superfamily hydrolase  34.4 
 
 		 228 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.151709  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0412  HAD family hydrolase  31.51 
 
 		 230 aa  111  8.000000000000001e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.983661  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0730  haloacid dehalogenase, IA family protein  34.4 
 
 		 228 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2715  HAD-superfamily hydrolase  34.4 
 
 		 228 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2363  HAD-superfamily hydrolase  34.4 
 
 		 228 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.340076  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2640  HAD family hydrolase  38.12 
 
 		 237 aa  111  9e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.576989  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3616  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.7 
 
 		 228 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4077  6-phosphogluconate phosphatase  32.74 
 
 		 221 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0694  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.82 
 
 		 229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3293  HAD family hydrolase  34.53 
 
 		 245 aa  109  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.567903  normal  0.782847 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4082  6-phosphogluconate phosphatase  31.67 
 
 		 221 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.580327 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4007  6-phosphogluconate phosphatase  32.13 
 
 		 222 aa  109  5e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5146  6-phosphogluconate phosphatase  31.22 
 
 		 221 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.107109 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4133  6-phosphogluconate phosphatase  31.84 
 
 		 221 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0258255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0539  HAD family hydrolase  31.25 
 
 		 231 aa  106  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598939  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4240  6-phosphogluconate phosphatase  31.84 
 
 		 221 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0636361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4061  6-phosphogluconate phosphatase  31.84 
 
 		 221 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5923  HAD family hydrolase  37.22 
 
 		 228 aa  105  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>