206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2259 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2259  export protein FliQ family 3  100 
 
 		 60 aa  117  7e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.206575  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1752  flagellar biosynthetic protein FliQ  49.15 
 
 		 89 aa  63.5  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1752  flagellar biosynthetic protein FliQ  49.15 
 
 		 89 aa  63.5  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0009  flagellar biosynthetic protein FliQ  45.76 
 
 		 89 aa  62.8  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.716159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0742  export protein FliQ  45 
 
 		 89 aa  62.4  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0764  flagellar biosynthetic protein FliQ  46.55 
 
 		 89 aa  61.6  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4758  flagellar biosynthesis protein FliQ  46.55 
 
 		 89 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0972235  normal  0.81489 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3681  flagellar biosynthesis protein FliQ  46.55 
 
 		 89 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.123867  normal  0.80121 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0067  flagellar biosynthetic protein FliQ  48.08 
 
 		 91 aa  61.6  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1125  flagellar biosynthetic protein FliQ  55.17 
 
 		 89 aa  61.6  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.533326 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0156  flagellar biosynthetic protein FliQ  49.15 
 
 		 91 aa  60.8  0.000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0711  flagellar biosynthetic protein FliQ  49.12 
 
 		 89 aa  60.8  0.000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2911  flagellar biosynthesis protein FliQ  45.76 
 
 		 89 aa  60.1  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.363485  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1966  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.37 
 
 		 89 aa  59.7  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2156  flagellar biosynthetic protein FliQ  48.21 
 
 		 89 aa  58.9  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.504575  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2942  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.68 
 
 		 89 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0858  flagellar biosynthetic protein FliQ  44.07 
 
 		 91 aa  58.5  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.387191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0482  flagellar biosynthetic protein FliQ  48.21 
 
 		 89 aa  58.5  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000227975  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0741  flagellar biosynthetic protein FliQ  48.21 
 
 		 89 aa  58.2  0.00000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.153743  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2005  flagellar biosynthesis protein FliQ  43.1 
 
 		 88 aa  58.2  0.00000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.207342  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1169  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.86 
 
 		 89 aa  58.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.843837  normal  0.0664804 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0374  flagellar biosynthesis protein FliQ  43.1 
 
 		 89 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5880  flagellar biosynthesis protein FliQ  44.64 
 
 		 89 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.11552  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0866  hypothetical protein  50 
 
 		 90 aa  57.8  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0787  flagellar biosynthetic protein FliQ  49.12 
 
 		 89 aa  57.4  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000782848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3070  flagellar biosynthetic protein FliQ  51.72 
 
 		 89 aa  57.4  0.00000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0602281  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3796  flagellar biosynthetic protein FliQ  51.72 
 
 		 89 aa  57.4  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2958  flagellar biosynthesis protein FliQ  42.11 
 
 		 89 aa  57.4  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1667  export protein FliQ family 3  44.83 
 
 		 92 aa  57.4  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00810896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2238  flagellar biosynthetic protein FliQ  44.83 
 
 		 88 aa  57.4  0.00000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31050  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.67 
 
 		 90 aa  56.6  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24120  flagellar biosynthetic protein  45.28 
 
 		 89 aa  56.2  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.169553  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0649  flagellar biosynthetic protein FliQ  52.73 
 
 		 89 aa  56.6  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2330  export protein FliQ family 3  42.37 
 
 		 90 aa  55.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0202535  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1356  flagellar biosynthesis protein FliQ  50.98 
 
 		 89 aa  56.2  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2403  flagellar biosynthesis protein FliQ  41.07 
 
 		 89 aa  56.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0656  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.35 
 
 		 89 aa  55.8  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4179  flagellar biosynthetic protein FliQ  45.28 
 
 		 89 aa  56.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2303  flagellar biosynthesis protein FliQ  41.07 
 
 		 89 aa  56.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2540  flagellar biosynthesis protein FliQ  40.35 
 
 		 89 aa  55.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.100837  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0185  flagellar biosynthetic protein FliQ  45.76 
 
 		 89 aa  55.1  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.67904e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1262  flagellar biosynthesis protein FliQ  42.86 
 
 		 89 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.1618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1139  flagellar biosynthesis protein FliQ  42.86 
 
 		 89 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00184506  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2138  flagellar biosynthesis protein FliQ  42.86 
 
 		 89 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.19907 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2196  flagellar biosynthesis protein FliQ  42.86 
 
 		 89 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.15457  normal  0.786149 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0561  flagellar biosynthetic protein FliQ  52.94 
 
 		 85 aa  54.3  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.68477  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1967  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.64 
 
 		 89 aa  54.3  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0103073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2010  flagellar biosynthetic protein FliQ  39.66 
 
 		 90 aa  54.3  0.0000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1551  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.86 
 
 		 89 aa  54.3  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5302  flagellar biosynthesis protein FliQ  44.23 
 
 		 89 aa  53.9  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.84251  normal  0.100483 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4354  flagellar biosynthesis protein FliQ  37.29 
 
 		 89 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.793303  normal  0.271158 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2034  flagellar biosynthetic protein FliQ  48.98 
 
 		 89 aa  53.9  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.269793  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1512  flagellar biosynthesis protein FliQ  37.29 
 
 		 89 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.294208  normal  0.120584 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0625  flagellar biosynthetic protein FliQ  45.28 
 
 		 90 aa  53.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1550  flagellar biosynthesis protein FliQ  40.35 
 
 		 89 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00974617  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3096  flagellar biosynthesis protein FliQ  38.98 
 
 		 89 aa  53.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1565  flagellar biosynthesis protein FliQ  41.07 
 
 		 89 aa  53.1  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.101104  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3916  flagellar biosynthesis protein FliQ  37.29 
 
 		 89 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.413536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1880  flagellar biosynthesis protein FliQ  39.29 
 
 		 89 aa  53.1  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3433  flagellar biosynthetic protein FliQ  45.61 
 
 		 89 aa  53.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0762  flagellar biosynthesis protein FliQ  40.68 
 
 		 83 aa  52.4  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.187731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001179  flagellar biosynthesis protein FliQ  40.68 
 
 		 89 aa  52.4  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.824092  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2161  flagellar biosynthesis protein FliQ  45.61 
 
 		 89 aa  52.8  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0979  flagellar biosynthetic protein FliQ  43.1 
 
 		 89 aa  52  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.277677  normal  0.0178906 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0705  flagellar biosynthetic protein FliQ  45.28 
 
 		 90 aa  52.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00473714  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2586  flagellar biosynthesis protein FliQ  37.5 
 
 		 89 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04966  flagellar biosynthesis pathway, component FliQ  40.68 
 
 		 89 aa  52.4  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0240  flagellar biosynthetic protein FliQ  45.28 
 
 		 90 aa  52.8  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.331629  normal  0.0227388 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2698  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.82 
 
 		 89 aa  52  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.201121  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3680  flagellar biosynthesis protein FliQ  37.29 
 
 		 89 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0305386  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4066  export protein FliQ family 3  43.86 
 
 		 91 aa  52  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2395  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.68 
 
 		 89 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3582  flagellar biosynthetic protein FliQ  41.07 
 
 		 89 aa  51.2  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1332  flagellar biosynthetic protein FliQ  42 
 
 		 89 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.498706  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45760  flagellar biosynthesis protein FliQ  42.11 
 
 		 89 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4647  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.89 
 
 		 90 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.189721  normal  0.557325 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0424  flagellar biosynthetic protein FliQ  37.29 
 
 		 89 aa  50.8  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1410  flagellar biosynthetic protein FliQ  42.86 
 
 		 89 aa  50.8  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.741947  normal  0.72353 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1676  flagellar biosynthesis protein FliQ  44.64 
 
 		 89 aa  50.8  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2143  flagellar biosynthesis protein FliQ  42.86 
 
 		 89 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.133607  hitchhiker  0.00525204 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1165  flagellar biosynthetic protein FliQ  38.46 
 
 		 89 aa  50.4  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0961  export protein FliQ family 3  38.33 
 
 		 91 aa  49.7  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1973  flagellar biosynthetic protein FliQ  33.9 
 
 		 89 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00808662  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0280  flagellar biosynthetic protein FliQ  40.74 
 
 		 87 aa  49.7  0.00001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3443  flagellar biosynthesis protein FliQ  33.9 
 
 		 89 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.407013 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2823  flagellar biosynthesis protein FliQ  40.74 
 
 		 84 aa  50.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1117  flagellar biosynthesis protein FliQ  43.33 
 
 		 88 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1513  flagellar biosynthetic protein FliQ  36.21 
 
 		 89 aa  48.9  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1133  flagellar biosynthesis protein FliQ  40 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.307359  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2975  flagellar biosynthetic protein FliQ  36.67 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2182  flagellar biosynthesis protein FliQ  42.59 
 
 		 89 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000314942  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0154  flagellar biosynthesis protein FliQ  40.82 
 
 		 89 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.773854 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2726  flagellar biosynthesis protein FliQ  42.59 
 
 		 89 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00753995  normal  0.443134 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1070  flagellar biosynthesis protein FliQ  42.59 
 
 		 89 aa  48.9  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000148422  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3781  flagellar biosynthesis protein FliQ  40.82 
 
 		 89 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2049  flagellar biosynthesis protein FliQ  36.21 
 
 		 89 aa  48.9  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.44431  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2049  flagellar biosynthesis protein FliQ  42.59 
 
 		 89 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000496508  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1235  flagellar biosynthesis protein FliQ  42.59 
 
 		 89 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000102862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2811  flagellar biosynthesis protein FliQ  38.98 
 
 		 89 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.369637  normal  0.0394695 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1038  flagellar biosynthesis protein FliQ  40 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.409344  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>