26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1857 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1857  protein of unknown function DUF993  100 
 
 		 395 aa  798    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.471192  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1972  hypothetical protein  59.23 
 
 		 389 aa  472  1e-132  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0814948  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2050  hypothetical protein  58.97 
 
 		 389 aa  469  1.0000000000000001e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0869  hypothetical protein  60.77 
 
 		 389 aa  466  9.999999999999999e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4012  protein of unknown function DUF993  63.78 
 
 		 387 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4341  protein of unknown function DUF993  64.12 
 
 		 387 aa  456  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0569114  decreased coverage  0.00000104757 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3176  hypothetical protein  57.91 
 
 		 389 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3332  hypothetical protein  62.66 
 
 		 387 aa  449  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.581336 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2854  hypothetical protein  61.77 
 
 		 390 aa  445  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4177  protein of unknown function DUF993  58.12 
 
 		 389 aa  429  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.455034  decreased coverage  0.000150166 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2458  hypothetical protein  58.88 
 
 		 388 aa  419  1e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.21472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3928  hypothetical protein  55.58 
 
 		 387 aa  400  9.999999999999999e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2018  protein of unknown function DUF993  54.8 
 
 		 386 aa  385  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.267016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0648  protein of unknown function DUF993  56.12 
 
 		 388 aa  386  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3580  hypothetical protein  53.79 
 
 		 394 aa  387  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0148558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1106  protein of unknown function DUF993  51.65 
 
 		 387 aa  378  1e-103  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1720  hypothetical protein  54.57 
 
 		 388 aa  376  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.200731  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2178  protein of unknown function DUF993  51.23 
 
 		 404 aa  365  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000897732 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1078  hypothetical protein  54.32 
 
 		 376 aa  363  3e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6725  hypothetical protein  55.52 
 
 		 376 aa  355  5.999999999999999e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391855  normal  0.840388 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2424  hypothetical protein  51.84 
 
 		 404 aa  352  7e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.236246  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0139  hypothetical protein  55.33 
 
 		 358 aa  342  5.999999999999999e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1087  protein of unknown function DUF993  52.99 
 
 		 406 aa  342  1e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0186844  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4008  hypothetical protein  55.17 
 
 		 380 aa  338  9.999999999999999e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3366  protein of unknown function DUF993  49.01 
 
 		 422 aa  335  7e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.101266 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29080  Protein of unknown function (DUF993)  48.67 
 
 		 428 aa  314  1.9999999999999998e-84  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.192075  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>