26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4008 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_4008  hypothetical protein  100 
 
 
380 aa  743    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2018  protein of unknown function DUF993  64.51 
 
 
386 aa  408  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.267016  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6725  hypothetical protein  61.58 
 
 
376 aa  407  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391855  normal  0.840388 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2178  protein of unknown function DUF993  54.25 
 
 
404 aa  405  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000897732 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2424  hypothetical protein  54.5 
 
 
404 aa  395  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.236246  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1078  hypothetical protein  57.07 
 
 
376 aa  394  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3366  protein of unknown function DUF993  58.21 
 
 
422 aa  391  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.101266 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1720  hypothetical protein  62.35 
 
 
388 aa  382  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.200731  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1087  protein of unknown function DUF993  59.94 
 
 
406 aa  375  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0186844  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2854  hypothetical protein  57.8 
 
 
390 aa  375  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1106  protein of unknown function DUF993  54.62 
 
 
387 aa  365  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2458  hypothetical protein  54.92 
 
 
388 aa  360  2e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.21472  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1857  protein of unknown function DUF993  55.4 
 
 
395 aa  354  1e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.471192  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4012  protein of unknown function DUF993  56.21 
 
 
387 aa  351  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1972  hypothetical protein  50.42 
 
 
389 aa  350  2e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0814948  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3332  hypothetical protein  55.23 
 
 
387 aa  348  7e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.581336 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3176  hypothetical protein  52.85 
 
 
389 aa  347  2e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4341  protein of unknown function DUF993  56.78 
 
 
387 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0569114  decreased coverage  0.00000104757 
 
 
-
 
NC_004310  BR2050  hypothetical protein  49.86 
 
 
389 aa  347  3e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0869  hypothetical protein  50.42 
 
 
389 aa  344  1e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0139  hypothetical protein  54.7 
 
 
358 aa  333  2e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3928  hypothetical protein  51.12 
 
 
387 aa  331  1e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4177  protein of unknown function DUF993  51.12 
 
 
389 aa  325  6e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.455034  decreased coverage  0.000150166 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29080  Protein of unknown function (DUF993)  50.39 
 
 
428 aa  312  5.999999999999999e-84  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.192075  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3580  hypothetical protein  48.86 
 
 
394 aa  294  2e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0148558  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0648  protein of unknown function DUF993  48.21 
 
 
388 aa  293  5e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>