26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3366 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3366  protein of unknown function DUF993  100 
 
 
422 aa  831    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.101266 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2178  protein of unknown function DUF993  61.27 
 
 
404 aa  477  1e-133  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000897732 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2424  hypothetical protein  61.58 
 
 
404 aa  471  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.236246  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1087  protein of unknown function DUF993  62.94 
 
 
406 aa  429  1e-119  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0186844  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2018  protein of unknown function DUF993  58.63 
 
 
386 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.267016  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1720  hypothetical protein  62 
 
 
388 aa  394  1e-108  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.200731  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2854  hypothetical protein  54.31 
 
 
390 aa  378  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6725  hypothetical protein  58.46 
 
 
376 aa  370  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391855  normal  0.840388 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2458  hypothetical protein  56.64 
 
 
388 aa  367  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.21472  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4012  protein of unknown function DUF993  54.92 
 
 
387 aa  366  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1078  hypothetical protein  53.92 
 
 
376 aa  365  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3332  hypothetical protein  55.11 
 
 
387 aa  364  2e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.581336 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4008  hypothetical protein  57.71 
 
 
380 aa  363  2e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4341  protein of unknown function DUF993  55.59 
 
 
387 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0569114  decreased coverage  0.00000104757 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1972  hypothetical protein  47.44 
 
 
389 aa  332  6e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0814948  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1857  protein of unknown function DUF993  49.26 
 
 
395 aa  332  8e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.471192  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0139  hypothetical protein  52.99 
 
 
358 aa  332  8e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0869  hypothetical protein  46.02 
 
 
389 aa  332  9e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29080  Protein of unknown function (DUF993)  50 
 
 
428 aa  332  9e-90  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.192075  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3580  hypothetical protein  51.37 
 
 
394 aa  331  1e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0148558  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2050  hypothetical protein  46.9 
 
 
389 aa  328  9e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3176  hypothetical protein  46.62 
 
 
389 aa  321  9.999999999999999e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4177  protein of unknown function DUF993  48.73 
 
 
389 aa  316  5e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.455034  decreased coverage  0.000150166 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3928  hypothetical protein  48.76 
 
 
387 aa  315  7e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1106  protein of unknown function DUF993  48.15 
 
 
387 aa  315  9e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0648  protein of unknown function DUF993  47.99 
 
 
388 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>