26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1078 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1078  hypothetical protein  100 
 
 
376 aa  761    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2018  protein of unknown function DUF993  63.53 
 
 
386 aa  419  1e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.267016  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6725  hypothetical protein  59.95 
 
 
376 aa  414  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391855  normal  0.840388 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1720  hypothetical protein  61.25 
 
 
388 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.200731  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2854  hypothetical protein  59.89 
 
 
390 aa  400  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2458  hypothetical protein  58.81 
 
 
388 aa  389  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.21472  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2178  protein of unknown function DUF993  53.48 
 
 
404 aa  387  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000897732 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3176  hypothetical protein  54.01 
 
 
389 aa  377  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2424  hypothetical protein  52.99 
 
 
404 aa  376  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.236246  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4008  hypothetical protein  57.68 
 
 
380 aa  375  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1087  protein of unknown function DUF993  59.21 
 
 
406 aa  373  1e-102  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0186844  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4012  protein of unknown function DUF993  54.4 
 
 
387 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1106  protein of unknown function DUF993  55.97 
 
 
387 aa  374  1e-102  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0139  hypothetical protein  58.19 
 
 
358 aa  372  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3332  hypothetical protein  55.96 
 
 
387 aa  365  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.581336 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0869  hypothetical protein  51.65 
 
 
389 aa  365  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4341  protein of unknown function DUF993  55.18 
 
 
387 aa  363  3e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0569114  decreased coverage  0.00000104757 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3580  hypothetical protein  55.56 
 
 
394 aa  360  2e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0148558  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1972  hypothetical protein  51.98 
 
 
389 aa  360  2e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0814948  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1857  protein of unknown function DUF993  54.32 
 
 
395 aa  360  2e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.471192  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2050  hypothetical protein  51.41 
 
 
389 aa  357  1.9999999999999998e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3366  protein of unknown function DUF993  53.92 
 
 
422 aa  352  5e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.101266 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3928  hypothetical protein  52.25 
 
 
387 aa  348  1e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4177  protein of unknown function DUF993  53.8 
 
 
389 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.455034  decreased coverage  0.000150166 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0648  protein of unknown function DUF993  54.83 
 
 
388 aa  338  7e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29080  Protein of unknown function (DUF993)  50.92 
 
 
428 aa  324  2e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.192075  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>