26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2424 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2424  hypothetical protein  100 
 
 		 404 aa  812    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.236246  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2178  protein of unknown function DUF993  89.11 
 
 		 404 aa  713    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000897732 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3366  protein of unknown function DUF993  61.58 
 
 		 422 aa  480  1e-134  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.101266 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2018  protein of unknown function DUF993  60.45 
 
 		 386 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.267016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1087  protein of unknown function DUF993  58.4 
 
 		 406 aa  432  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0186844  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2854  hypothetical protein  54.5 
 
 		 390 aa  396  1e-109  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6725  hypothetical protein  56.14 
 
 		 376 aa  393  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391855  normal  0.840388 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1720  hypothetical protein  55.69 
 
 		 388 aa  384  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.200731  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2458  hypothetical protein  53.62 
 
 		 388 aa  379  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.21472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1078  hypothetical protein  53.48 
 
 		 376 aa  381  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4008  hypothetical protein  55 
 
 		 380 aa  379  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3176  hypothetical protein  50.12 
 
 		 389 aa  373  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29080  Protein of unknown function (DUF993)  51.09 
 
 		 428 aa  372  1e-102  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.192075  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1972  hypothetical protein  48.25 
 
 		 389 aa  364  1e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0814948  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0139  hypothetical protein  56.28 
 
 		 358 aa  362  6e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0869  hypothetical protein  48.5 
 
 		 389 aa  361  1e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2050  hypothetical protein  47.75 
 
 		 389 aa  360  2e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4012  protein of unknown function DUF993  50.87 
 
 		 387 aa  355  8.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1857  protein of unknown function DUF993  51.84 
 
 		 395 aa  353  2e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.471192  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4341  protein of unknown function DUF993  51.98 
 
 		 387 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0569114  decreased coverage  0.00000104757 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3928  hypothetical protein  50.25 
 
 		 387 aa  352  8.999999999999999e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3332  hypothetical protein  50.37 
 
 		 387 aa  349  6e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.581336 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4177  protein of unknown function DUF993  48.76 
 
 		 389 aa  340  2e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.455034  decreased coverage  0.000150166 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3580  hypothetical protein  49.38 
 
 		 394 aa  340  2.9999999999999998e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0148558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1106  protein of unknown function DUF993  50.28 
 
 		 387 aa  331  1e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0648  protein of unknown function DUF993  46.42 
 
 		 388 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>