26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3332 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3332  hypothetical protein  100 
 
 		 387 aa  781    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.581336 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4012  protein of unknown function DUF993  82.9 
 
 		 387 aa  645    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4341  protein of unknown function DUF993  83.42 
 
 		 387 aa  630  1e-179  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0569114  decreased coverage  0.00000104757 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2458  hypothetical protein  68.56 
 
 		 388 aa  467  9.999999999999999e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.21472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2854  hypothetical protein  64.92 
 
 		 390 aa  461  9.999999999999999e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1857  protein of unknown function DUF993  62.66 
 
 		 395 aa  458  9.999999999999999e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.471192  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3176  hypothetical protein  60.47 
 
 		 389 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1972  hypothetical protein  56.27 
 
 		 389 aa  431  1e-119  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0814948  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0869  hypothetical protein  56.1 
 
 		 389 aa  429  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2050  hypothetical protein  55.73 
 
 		 389 aa  427  1e-118  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3580  hypothetical protein  61.3 
 
 		 394 aa  416  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0148558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4177  protein of unknown function DUF993  56.62 
 
 		 389 aa  413  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.455034  decreased coverage  0.000150166 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2018  protein of unknown function DUF993  56.01 
 
 		 386 aa  396  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.267016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1106  protein of unknown function DUF993  58.19 
 
 		 387 aa  397  1e-109  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0648  protein of unknown function DUF993  57.73 
 
 		 388 aa  395  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3928  hypothetical protein  54.92 
 
 		 387 aa  391  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1078  hypothetical protein  55.96 
 
 		 376 aa  388  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3366  protein of unknown function DUF993  54.62 
 
 		 422 aa  378  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.101266 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1087  protein of unknown function DUF993  55.76 
 
 		 406 aa  377  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0186844  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6725  hypothetical protein  56.44 
 
 		 376 aa  376  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391855  normal  0.840388 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2178  protein of unknown function DUF993  52.85 
 
 		 404 aa  373  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000897732 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1720  hypothetical protein  56.14 
 
 		 388 aa  367  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.200731  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2424  hypothetical protein  50.37 
 
 		 404 aa  359  5e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.236246  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0139  hypothetical protein  56.14 
 
 		 358 aa  356  3.9999999999999996e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4008  hypothetical protein  55.23 
 
 		 380 aa  338  9.999999999999999e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29080  Protein of unknown function (DUF993)  47.49 
 
 		 428 aa  291  1e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.192075  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>