26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4012 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_4341  protein of unknown function DUF993  94.83 
 
 
387 aa  712    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0569114  decreased coverage  0.00000104757 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4012  protein of unknown function DUF993  100 
 
 
387 aa  785    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3332  hypothetical protein  82.9 
 
 
387 aa  629  1e-179  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.581336 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1857  protein of unknown function DUF993  63.78 
 
 
395 aa  457  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.471192  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2854  hypothetical protein  63.9 
 
 
390 aa  452  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2458  hypothetical protein  67.71 
 
 
388 aa  451  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.21472  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3176  hypothetical protein  60.21 
 
 
389 aa  442  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1972  hypothetical protein  56.51 
 
 
389 aa  431  1e-119  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0814948  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2050  hypothetical protein  55.99 
 
 
389 aa  426  1e-118  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0869  hypothetical protein  56.76 
 
 
389 aa  425  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4177  protein of unknown function DUF993  57.14 
 
 
389 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.455034  decreased coverage  0.000150166 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2018  protein of unknown function DUF993  57.54 
 
 
386 aa  402  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.267016  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3580  hypothetical protein  57.73 
 
 
394 aa  403  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0148558  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1106  protein of unknown function DUF993  58.48 
 
 
387 aa  394  1e-108  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3928  hypothetical protein  54.62 
 
 
387 aa  389  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0648  protein of unknown function DUF993  57.22 
 
 
388 aa  387  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1078  hypothetical protein  54.4 
 
 
376 aa  373  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1087  protein of unknown function DUF993  55.71 
 
 
406 aa  367  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0186844  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2178  protein of unknown function DUF993  50.37 
 
 
404 aa  365  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000897732 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3366  protein of unknown function DUF993  54.92 
 
 
422 aa  367  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.101266 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1720  hypothetical protein  55.01 
 
 
388 aa  367  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.200731  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6725  hypothetical protein  56.25 
 
 
376 aa  364  2e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391855  normal  0.840388 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0139  hypothetical protein  56.73 
 
 
358 aa  355  1e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2424  hypothetical protein  50.87 
 
 
404 aa  352  8.999999999999999e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.236246  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4008  hypothetical protein  55.1 
 
 
380 aa  331  2e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29080  Protein of unknown function (DUF993)  42.86 
 
 
428 aa  269  5e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.192075  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>