26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1720 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1720  hypothetical protein  100 
 
 		 388 aa  767    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.200731  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2018  protein of unknown function DUF993  75.78 
 
 		 386 aa  554  1e-157  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.267016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6725  hypothetical protein  62.6 
 
 		 376 aa  423  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391855  normal  0.840388 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1972  hypothetical protein  53.47 
 
 		 389 aa  419  1e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0814948  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2854  hypothetical protein  58.18 
 
 		 390 aa  418  1e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2050  hypothetical protein  52.96 
 
 		 389 aa  415  9.999999999999999e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1078  hypothetical protein  61.25 
 
 		 376 aa  417  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3366  protein of unknown function DUF993  59.2 
 
 		 422 aa  417  9.999999999999999e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.101266 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0869  hypothetical protein  53.98 
 
 		 389 aa  415  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2178  protein of unknown function DUF993  54.95 
 
 		 404 aa  414  1e-114  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000897732 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3176  hypothetical protein  55.75 
 
 		 389 aa  412  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2458  hypothetical protein  58.33 
 
 		 388 aa  411  1e-113  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.21472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2424  hypothetical protein  55.69 
 
 		 404 aa  407  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.236246  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1087  protein of unknown function DUF993  58.27 
 
 		 406 aa  396  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0186844  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4012  protein of unknown function DUF993  55.27 
 
 		 387 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1857  protein of unknown function DUF993  55.19 
 
 		 395 aa  394  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.471192  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4341  protein of unknown function DUF993  55.64 
 
 		 387 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0569114  decreased coverage  0.00000104757 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3928  hypothetical protein  55.04 
 
 		 387 aa  385  1e-106  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4008  hypothetical protein  59.64 
 
 		 380 aa  382  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1106  protein of unknown function DUF993  52.07 
 
 		 387 aa  377  1e-103  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3332  hypothetical protein  55.06 
 
 		 387 aa  374  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.581336 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3580  hypothetical protein  53.61 
 
 		 394 aa  372  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0148558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4177  protein of unknown function DUF993  52.58 
 
 		 389 aa  370  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.455034  decreased coverage  0.000150166 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0648  protein of unknown function DUF993  52.21 
 
 		 388 aa  355  5.999999999999999e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0139  hypothetical protein  59.48 
 
 		 358 aa  352  8e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29080  Protein of unknown function (DUF993)  47.95 
 
 		 428 aa  334  1e-90  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.192075  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>