26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3176 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3176  hypothetical protein  100 
 
 		 389 aa  791    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1972  hypothetical protein  72.73 
 
 		 389 aa  596  1e-169  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0814948  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2050  hypothetical protein  72.21 
 
 		 389 aa  592  1e-168  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0869  hypothetical protein  73.44 
 
 		 389 aa  591  1e-168  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1857  protein of unknown function DUF993  57.91 
 
 		 395 aa  447  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.471192  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4012  protein of unknown function DUF993  60.21 
 
 		 387 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2854  hypothetical protein  59.33 
 
 		 390 aa  431  1e-119  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4177  protein of unknown function DUF993  57.29 
 
 		 389 aa  428  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.455034  decreased coverage  0.000150166 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3580  hypothetical protein  59.43 
 
 		 394 aa  425  1e-118  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0148558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3332  hypothetical protein  60.47 
 
 		 387 aa  427  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.581336 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2458  hypothetical protein  57.77 
 
 		 388 aa  424  1e-117  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.21472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3928  hypothetical protein  54.95 
 
 		 387 aa  419  1e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4341  protein of unknown function DUF993  60.15 
 
 		 387 aa  421  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0569114  decreased coverage  0.00000104757 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2018  protein of unknown function DUF993  55.15 
 
 		 386 aa  389  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.267016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1078  hypothetical protein  54.01 
 
 		 376 aa  379  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1720  hypothetical protein  55.75 
 
 		 388 aa  379  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.200731  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0648  protein of unknown function DUF993  54.64 
 
 		 388 aa  373  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6725  hypothetical protein  55.58 
 
 		 376 aa  374  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391855  normal  0.840388 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2178  protein of unknown function DUF993  48.76 
 
 		 404 aa  368  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000897732 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1106  protein of unknown function DUF993  52.07 
 
 		 387 aa  368  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2424  hypothetical protein  50.12 
 
 		 404 aa  361  1e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.236246  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0139  hypothetical protein  56.84 
 
 		 358 aa  342  8e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1087  protein of unknown function DUF993  50 
 
 		 406 aa  335  1e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0186844  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4008  hypothetical protein  53.13 
 
 		 380 aa  323  3e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3366  protein of unknown function DUF993  46.62 
 
 		 422 aa  318  1e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.101266 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29080  Protein of unknown function (DUF993)  44.47 
 
 		 428 aa  293  4e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.192075  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>