26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4341 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_4341  protein of unknown function DUF993  100 
 
 
387 aa  785    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0569114  decreased coverage  0.00000104757 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4012  protein of unknown function DUF993  94.83 
 
 
387 aa  729    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3332  hypothetical protein  83.42 
 
 
387 aa  631  1e-180  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.581336 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1857  protein of unknown function DUF993  64.12 
 
 
395 aa  466  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.471192  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2458  hypothetical protein  68.08 
 
 
388 aa  458  9.999999999999999e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.21472  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2854  hypothetical protein  63.99 
 
 
390 aa  457  1e-127  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3176  hypothetical protein  60.15 
 
 
389 aa  439  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1972  hypothetical protein  57.29 
 
 
389 aa  436  1e-121  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0814948  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2050  hypothetical protein  56.77 
 
 
389 aa  431  1e-119  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0869  hypothetical protein  57.56 
 
 
389 aa  431  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4177  protein of unknown function DUF993  57.4 
 
 
389 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.455034  decreased coverage  0.000150166 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2018  protein of unknown function DUF993  57.14 
 
 
386 aa  404  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.267016  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3580  hypothetical protein  59.89 
 
 
394 aa  400  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0148558  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3928  hypothetical protein  55.53 
 
 
387 aa  398  9.999999999999999e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1106  protein of unknown function DUF993  56.88 
 
 
387 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0648  protein of unknown function DUF993  57.07 
 
 
388 aa  389  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1078  hypothetical protein  55.18 
 
 
376 aa  379  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3366  protein of unknown function DUF993  55.59 
 
 
422 aa  374  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.101266 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6725  hypothetical protein  56.79 
 
 
376 aa  374  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391855  normal  0.840388 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1720  hypothetical protein  55.64 
 
 
388 aa  374  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.200731  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1087  protein of unknown function DUF993  57.38 
 
 
406 aa  370  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0186844  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2178  protein of unknown function DUF993  50.5 
 
 
404 aa  371  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000897732 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2424  hypothetical protein  51.98 
 
 
404 aa  364  1e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.236246  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0139  hypothetical protein  57.6 
 
 
358 aa  363  3e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4008  hypothetical protein  55.69 
 
 
380 aa  338  9.999999999999999e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29080  Protein of unknown function (DUF993)  43.58 
 
 
428 aa  276  6e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.192075  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>