259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1681 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1681  adenosine deaminase  100 
 
 		 385 aa  791    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.160751  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2520  adenosine deaminase  86 
 
 		 369 aa  625  1e-178  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3107  adenosine deaminase  66.37 
 
 		 366 aa  481  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.323824  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5260  adenosine deaminase  66.37 
 
 		 366 aa  481  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.402551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5013  adenosine deaminase  66.37 
 
 		 366 aa  480  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0987711  normal  0.802668 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0389  adenosine deaminase  66.08 
 
 		 366 aa  479  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.95283  normal  0.744647 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5147  adenosine deaminase  64.33 
 
 		 366 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.688853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4621  adenosine deaminase  64.33 
 
 		 366 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0633  adenosine deaminase  41.67 
 
 		 343 aa  229  7e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.410378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2063  adenosine deaminase  35.96 
 
 		 351 aa  187  3e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.700845 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1236  adenosine deaminase  33.23 
 
 		 338 aa  157  2e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0317068  normal  0.0334679 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1370  adenosine deaminase  32.65 
 
 		 335 aa  157  4e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.948473  normal  0.588673 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000592  adenosine deaminase  30.56 
 
 		 337 aa  156  5.0000000000000005e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0024296  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3297  adenosine deaminase  31.58 
 
 		 345 aa  155  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.184449  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0615  adenosine deaminase  28.53 
 
 		 326 aa  154  2.9999999999999998e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1922  adenosine deaminase  30.67 
 
 		 335 aa  152  5.9999999999999996e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0127981  normal  0.868909 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0631  adenosine deaminase  28.31 
 
 		 326 aa  152  1e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3185  adenosine deaminase  30.77 
 
 		 341 aa  151  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.175868  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2098  adenosine deaminase  30.98 
 
 		 345 aa  149  8e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.432045 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0766  adenosine deaminase  35.56 
 
 		 334 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06421  adenosine deaminase  29.22 
 
 		 335 aa  147  4.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3887  adenosine deaminase  31.1 
 
 		 365 aa  147  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.27836  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2390  adenosine deaminase  29.15 
 
 		 346 aa  144  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1925  adenosine deaminase  29.79 
 
 		 345 aa  143  4e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.10145  normal  0.0739212 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4230  adenosine deaminase  30.79 
 
 		 343 aa  143  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0844649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03345  Adenosine deaminase  27.62 
 
 		 337 aa  143  5e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2249  adenosine deaminase  29.79 
 
 		 345 aa  143  6e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0997  adenosine deaminase  35.38 
 
 		 353 aa  143  6e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0123518 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1083  adenosine deaminase  31.12 
 
 		 350 aa  142  7e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.906329  normal  0.364654 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1138  adenosine deaminase  30.73 
 
 		 375 aa  142  8e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0503551  normal  0.110025 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0648  adenosine deaminase  31.83 
 
 		 343 aa  142  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0773  adenosine deaminase  30.7 
 
 		 347 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0916  adenosine deaminase  30.7 
 
 		 347 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2442  adenosine deaminase  31.43 
 
 		 350 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0456  adenosine deaminase  26.83 
 
 		 332 aa  141  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0890  adenosine deaminase  30.49 
 
 		 354 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00447351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0816  adenosine deaminase  29.7 
 
 		 339 aa  140  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.819671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2009  adenosine deaminase  30.15 
 
 		 341 aa  139  7e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0350723  normal  0.0124667 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0907  adenosine deaminase  30.06 
 
 		 378 aa  139  8.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2140  Adenosine deaminase  29.6 
 
 		 333 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.291028 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1040  adenosine deaminase  30.43 
 
 		 346 aa  139  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2715  adenosine deaminase  27.71 
 
 		 339 aa  138  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2144  adenosine deaminase  30.86 
 
 		 349 aa  137  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.455932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1487  adenosine deaminase  30.61 
 
 		 360 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.51175 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1001  adenosine deaminase  29.83 
 
 		 349 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3177  adenosine deaminase  32.08 
 
 		 346 aa  137  4e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00286404  normal  0.437767 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1524  adenosine deaminase  29.43 
 
 		 341 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1612  adenosine deaminase  30.77 
 
 		 341 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4131  adenosine deaminase  30.47 
 
 		 341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2797  adenosine deaminase  30.64 
 
 		 346 aa  134  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000659545  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0710  adenosine deaminase  30.46 
 
 		 346 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.256846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1580  adenosine deaminase  28 
 
 		 344 aa  133  5e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2428  adenosine deaminase  33.57 
 
 		 351 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.253507  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1916  adenosine deaminase  29.36 
 
 		 361 aa  132  6.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4345  adenosine deaminase  31.82 
 
 		 341 aa  132  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2867  adenosine deaminase  30.57 
 
 		 353 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0978  adenosine deaminase  30.18 
 
 		 341 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0964411 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0541  adenosine deaminase  30.27 
 
 		 682 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.54598  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0636  adenosine deaminase  30.72 
 
 		 315 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.839693  hitchhiker  0.0000731257 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1020  adenosine deaminase  30.27 
 
 		 682 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.916957  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2376  adenosine deaminase  29.5 
 
 		 341 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.534573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0895  adenosine deaminase  29.59 
 
 		 341 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.326355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2420  adenosine deaminase  27.33 
 
 		 338 aa  130  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.285507  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0809  adenosine deaminase  26.89 
 
 		 338 aa  130  3e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3706  adenosine deaminase  31.33 
 
 		 315 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0631  adenosine deaminase  29.94 
 
 		 318 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000218139  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1432  adenosine deaminase  32.92 
 
 		 328 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.406795 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0591  adenosine deaminase  30.09 
 
 		 315 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.904203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2399  adenosine deaminase  28.69 
 
 		 355 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1359  adenosine deaminase  26.81 
 
 		 336 aa  129  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3021  adenosine deaminase  28.96 
 
 		 341 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.850327  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1745  adenosine deaminase  28.01 
 
 		 335 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0282  adenosine deaminase  26.95 
 
 		 328 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2916  adenosine deaminase  28.96 
 
 		 341 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2976  adenosine deaminase  28.96 
 
 		 341 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0947  adenosine deaminase  29.67 
 
 		 350 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.387168 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0809  adenosine deaminase  29.43 
 
 		 357 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.429813  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0461  adenosine deaminase  29.04 
 
 		 341 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.411498  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0281  adenosine deaminase  26.75 
 
 		 338 aa  127  3e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0883  adenosine deaminase  29.25 
 
 		 341 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2607  adenosine deaminase  29.04 
 
 		 341 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.580496  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0979  adenosine deaminase  29.04 
 
 		 341 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2430  adenosine deaminase  31.23 
 
 		 366 aa  127  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.10229  normal  0.205271 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0168  adenosine deaminase  29.04 
 
 		 341 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4572  adenosine deaminase  29.78 
 
 		 315 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000497344  hitchhiker  0.0072134 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0226  adenosine deaminase  30.22 
 
 		 316 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3173  adenosine deaminase  27.74 
 
 		 337 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.523168  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1969  adenosine deaminase  28 
 
 		 329 aa  126  5e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000161701  unclonable  0.0000000410528 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02509  adenosine deaminase  27.63 
 
 		 336 aa  126  8.000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0990384  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0004  putative adenosine deaminase  25.96 
 
 		 330 aa  125  1e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01830  adenosine deaminase  30.22 
 
 		 316 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.40459  normal  0.775613 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0692  adenosine deaminase  28.01 
 
 		 335 aa  125  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0045  adenosine deaminase  27.7 
 
 		 354 aa  124  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3044  adenosine deaminase  29.45 
 
 		 350 aa  125  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00967861  normal  0.0350825 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2485  adenosine deaminase  29.46 
 
 		 339 aa  124  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0868  adenosine deaminase  27.98 
 
 		 343 aa  124  4e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3742  adenosine deaminase  28.74 
 
 		 356 aa  124  4e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1779  adenosine deaminase  30.61 
 
 		 340 aa  123  5e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.569092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0671  adenosine deaminase  28.35 
 
 		 317 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6098  adenosine deaminase  33.54 
 
 		 368 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0272536 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>