260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4621 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_5147  adenosine deaminase  98.36 
 
 		 366 aa  733    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.688853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0389  adenosine deaminase  94.52 
 
 		 366 aa  708    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.95283  normal  0.744647 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3107  adenosine deaminase  94.52 
 
 		 366 aa  708    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.323824  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5013  adenosine deaminase  94.25 
 
 		 366 aa  706    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0987711  normal  0.802668 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4621  adenosine deaminase  100 
 
 		 366 aa  746    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5260  adenosine deaminase  94.52 
 
 		 366 aa  708    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.402551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2520  adenosine deaminase  64.69 
 
 		 369 aa  461  1e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1681  adenosine deaminase  64.33 
 
 		 385 aa  457  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.160751  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0633  adenosine deaminase  38.42 
 
 		 343 aa  208  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.410378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2063  adenosine deaminase  34.74 
 
 		 351 aa  177  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.700845 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0766  adenosine deaminase  33.53 
 
 		 334 aa  153  4e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2829  adenosine deaminase  27.66 
 
 		 332 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3185  adenosine deaminase  30.67 
 
 		 341 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.175868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000592  adenosine deaminase  29.67 
 
 		 337 aa  146  5e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0024296  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0773  adenosine deaminase  31.52 
 
 		 347 aa  146  5e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0916  adenosine deaminase  31.52 
 
 		 347 aa  146  5e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2515  adenosine deaminase  27.6 
 
 		 332 aa  144  2e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0997  adenosine deaminase  31.48 
 
 		 353 aa  142  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0123518 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1370  adenosine deaminase  31.45 
 
 		 335 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.948473  normal  0.588673 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1524  adenosine deaminase  33.8 
 
 		 341 aa  140  3e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3177  adenosine deaminase  32.06 
 
 		 346 aa  139  4.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00286404  normal  0.437767 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06421  adenosine deaminase  30.29 
 
 		 335 aa  139  6e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3887  adenosine deaminase  30.82 
 
 		 365 aa  139  8.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.27836  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2098  adenosine deaminase  30.79 
 
 		 345 aa  139  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.432045 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0907  adenosine deaminase  29.97 
 
 		 378 aa  138  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2485  adenosine deaminase  31.61 
 
 		 339 aa  138  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1922  adenosine deaminase  27.91 
 
 		 335 aa  137  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0127981  normal  0.868909 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2797  adenosine deaminase  30.27 
 
 		 346 aa  137  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000659545  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22300  adenosine deaminase  30.84 
 
 		 315 aa  136  4e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0631  adenosine deaminase  27.86 
 
 		 326 aa  135  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0648  adenosine deaminase  29.86 
 
 		 343 aa  135  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2430  adenosine deaminase  31.25 
 
 		 366 aa  134  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.10229  normal  0.205271 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2009  adenosine deaminase  31.58 
 
 		 341 aa  134  3e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0350723  normal  0.0124667 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0816  adenosine deaminase  30.84 
 
 		 339 aa  134  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.819671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0890  adenosine deaminase  29.75 
 
 		 354 aa  133  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00447351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1001  adenosine deaminase  29.88 
 
 		 349 aa  133  5e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1745  adenosine deaminase  29.67 
 
 		 335 aa  132  9e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3173  adenosine deaminase  31.31 
 
 		 337 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.523168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4230  adenosine deaminase  29.27 
 
 		 343 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0844649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0661  adenosine deaminase  30.75 
 
 		 317 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0671  adenosine deaminase  30.12 
 
 		 317 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1925  adenosine deaminase  30 
 
 		 345 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.10145  normal  0.0739212 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0710  adenosine deaminase  30.53 
 
 		 346 aa  130  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.256846  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0615  adenosine deaminase  26.85 
 
 		 326 aa  130  3e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3297  adenosine deaminase  30.28 
 
 		 345 aa  130  3e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.184449  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2249  adenosine deaminase  30 
 
 		 345 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1432  adenosine deaminase  32.41 
 
 		 328 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.406795 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0631  adenosine deaminase  30.43 
 
 		 318 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000218139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2428  adenosine deaminase  30.37 
 
 		 351 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.253507  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2399  adenosine deaminase  28.96 
 
 		 355 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0591  adenosine deaminase  30.43 
 
 		 315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.904203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2867  adenosine deaminase  32.21 
 
 		 353 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4572  adenosine deaminase  29.19 
 
 		 315 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000497344  hitchhiker  0.0072134 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3742  adenosine deaminase  30.33 
 
 		 356 aa  127  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2442  adenosine deaminase  28.61 
 
 		 350 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3706  adenosine deaminase  29.78 
 
 		 315 aa  127  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0226  adenosine deaminase  30.43 
 
 		 316 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1040  adenosine deaminase  30 
 
 		 346 aa  127  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2144  adenosine deaminase  29.5 
 
 		 349 aa  127  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.455932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0636  adenosine deaminase  30.12 
 
 		 315 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.839693  hitchhiker  0.0000731257 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12620  adenosine deaminase  29.2 
 
 		 342 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.341302 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0757  adenosine deaminase  30.43 
 
 		 317 aa  126  5e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2984  adenosine deaminase  29.73 
 
 		 325 aa  127  5e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.208704  normal  0.261493 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3021  adenosine deaminase  31.31 
 
 		 341 aa  126  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.850327  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2976  adenosine deaminase  31.31 
 
 		 341 aa  126  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1083  adenosine deaminase  28.15 
 
 		 350 aa  126  7e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.906329  normal  0.364654 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2916  adenosine deaminase  31.31 
 
 		 341 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3044  adenosine deaminase  29.08 
 
 		 350 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00967861  normal  0.0350825 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0895  adenosine deaminase  30.4 
 
 		 341 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.326355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0045  adenosine deaminase  28.77 
 
 		 354 aa  125  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0809  adenosine deaminase  32.66 
 
 		 357 aa  125  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.429813  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0461  adenosine deaminase  31 
 
 		 341 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.411498  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1612  adenosine deaminase  31.52 
 
 		 341 aa  124  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1983  adenosine deaminase  29.85 
 
 		 341 aa  125  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0004  putative adenosine deaminase  26.06 
 
 		 330 aa  124  2e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4345  adenosine deaminase  29.6 
 
 		 341 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1236  adenosine deaminase  30.63 
 
 		 338 aa  124  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0317068  normal  0.0334679 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0883  adenosine deaminase  30.65 
 
 		 341 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6098  adenosine deaminase  31.19 
 
 		 368 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0272536 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2607  adenosine deaminase  31 
 
 		 341 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.580496  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0979  adenosine deaminase  31 
 
 		 341 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0168  adenosine deaminase  31 
 
 		 341 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0456  adenosine deaminase  26.91 
 
 		 332 aa  124  3e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1916  adenosine deaminase  30.77 
 
 		 361 aa  124  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1138  adenosine deaminase  29.08 
 
 		 375 aa  124  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0503551  normal  0.110025 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01830  adenosine deaminase  29.81 
 
 		 316 aa  123  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.40459  normal  0.775613 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4458  adenosine deaminase  30.89 
 
 		 333 aa  123  6e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0947  adenosine deaminase  28.78 
 
 		 350 aa  123  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.387168 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1969  adenosine deaminase  27.13 
 
 		 329 aa  122  7e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000161701  unclonable  0.0000000410528 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1487  adenosine deaminase  33.33 
 
 		 360 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.51175 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3659  adenosine deaminase  29.55 
 
 		 325 aa  122  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03345  Adenosine deaminase  25.44 
 
 		 337 aa  122  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4131  adenosine deaminase  30.31 
 
 		 341 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0281  adenosine deaminase  26.46 
 
 		 338 aa  121  1.9999999999999998e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0978  adenosine deaminase  30.84 
 
 		 341 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0964411 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1359  adenosine deaminase  26.2 
 
 		 336 aa  120  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2140  Adenosine deaminase  28.92 
 
 		 333 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.291028 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2376  adenosine deaminase  30.18 
 
 		 341 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.534573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0541  adenosine deaminase  30.84 
 
 		 682 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.54598  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1020  adenosine deaminase  30.84 
 
 		 682 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.916957  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>