32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II1013 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II1013  putative heme binding protein  100 
 
 		 177 aa  360  4e-99  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1754  hypothetical protein  68.97 
 
 		 177 aa  251  3e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.213928 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003158  guanylate cyclase-related protein  60.89 
 
 		 179 aa  226  1e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01911  hypothetical protein  57.75 
 
 		 186 aa  224  7e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11538  putative guanylate cyclase-related protein  39.66 
 
 		 179 aa  137  1e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00897184  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6271  Heme NO binding domain protein  38.2 
 
 		 179 aa  135  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2751  heme NO binding domain-containing protein  33.93 
 
 		 182 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25984  normal  0.023799 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3098  Guanylate cyclase-related protein  33.52 
 
 		 183 aa  114  8.999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0133241  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4397  heme NO binding domain-containing protein  33.15 
 
 		 181 aa  106  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0582827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4860  Heme NO binding domain protein  33.15 
 
 		 181 aa  104  7e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.487803  normal  0.0981088 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1532  4-vinyl reductase, 4VR  34.32 
 
 		 181 aa  103  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3609  hypothetical protein  33.53 
 
 		 184 aa  100  7e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2525  hypothetical protein  33.33 
 
 		 184 aa  100  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2746  heme NO binding domain-containing protein  33.96 
 
 		 184 aa  98.6  4e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.463367  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2378  hypothetical protein  32.78 
 
 		 184 aa  96.7  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1373  Heme NO binding domain protein  28.74 
 
 		 182 aa  95.1  5e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.305689 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5547  Heme NO binding domain protein  32.91 
 
 		 180 aa  92.8  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2325  hypothetical protein  32.3 
 
 		 180 aa  91.7  5e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1053  hypothetical protein  31.87 
 
 		 180 aa  89.4  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0659  hypothetical protein  33.75 
 
 		 191 aa  84.7  6e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3804  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  27.65 
 
 		 180 aa  84.3  8e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00493  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  27.67 
 
 		 179 aa  78.2  0.00000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.202903  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3557  hypothetical protein  24.38 
 
 		 182 aa  67  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.566372 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2144  hypothetical protein  24.53 
 
 		 181 aa  62  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2084  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.86 
 
 		 597 aa  59.7  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0470  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  24.02 
 
 		 701 aa  54.7  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0387298 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1766  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.69 
 
 		 605 aa  52  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.053685  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1630  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.84 
 
 		 605 aa  51.2  0.000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00337409  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21990  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.98 
 
 		 604 aa  48.1  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1633  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.93 
 
 		 604 aa  47  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2264  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  21.76 
 
 		 604 aa  44.7  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0170  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.09 
 
 		 604 aa  43.9  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000484425  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>