33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1373 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1373  Heme NO binding domain protein  100 
 
 		 182 aa  377  1e-104  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.305689 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5547  Heme NO binding domain protein  49.14 
 
 		 180 aa  175  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1532  4-vinyl reductase, 4VR  36.72 
 
 		 181 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0659  hypothetical protein  32.97 
 
 		 191 aa  114  5e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3098  Guanylate cyclase-related protein  36.46 
 
 		 183 aa  111  5e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0133241  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3609  hypothetical protein  29.44 
 
 		 184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3804  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  32.4 
 
 		 180 aa  108  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3557  hypothetical protein  32.2 
 
 		 182 aa  105  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.566372 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1754  hypothetical protein  30.99 
 
 		 177 aa  103  9e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.213928 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2325  hypothetical protein  30.56 
 
 		 180 aa  103  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1053  hypothetical protein  30.56 
 
 		 180 aa  103  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2751  heme NO binding domain-containing protein  31.74 
 
 		 182 aa  102  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25984  normal  0.023799 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2144  hypothetical protein  29.61 
 
 		 181 aa  98.6  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4860  Heme NO binding domain protein  36.72 
 
 		 181 aa  97.8  8e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.487803  normal  0.0981088 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4397  heme NO binding domain-containing protein  36.72 
 
 		 181 aa  95.5  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0582827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1013  putative heme binding protein  28.74 
 
 		 177 aa  95.1  5e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11538  putative guanylate cyclase-related protein  27.81 
 
 		 179 aa  94.4  9e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00897184  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6271  Heme NO binding domain protein  33.97 
 
 		 179 aa  92.8  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01911  hypothetical protein  30.18 
 
 		 186 aa  91.7  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003158  guanylate cyclase-related protein  28.4 
 
 		 179 aa  87.8  7e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2746  heme NO binding domain-containing protein  34.97 
 
 		 184 aa  87.4  9e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.463367  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2525  hypothetical protein  34.9 
 
 		 184 aa  85.1  6e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2378  hypothetical protein  34.23 
 
 		 184 aa  80.9  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2675  Heme NO binding domain protein  28.8 
 
 		 189 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00493  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  31.61 
 
 		 179 aa  74.3  0.0000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.202903  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2084  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.81 
 
 		 597 aa  67  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21990  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.61 
 
 		 604 aa  62.8  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0470  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  24.71 
 
 		 701 aa  59.3  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0387298 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1630  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.55 
 
 		 605 aa  55.5  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00337409  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2264  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.21 
 
 		 604 aa  53.9  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1633  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  21.74 
 
 		 604 aa  48.9  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0549  heme NO binding domain-containing protein  22.36 
 
 		 417 aa  45.8  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.197755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1752  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.29 
 
 		 897 aa  46.2  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.10138  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>