28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1754 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1754  hypothetical protein  100 
 
 		 177 aa  369  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.213928 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1013  putative heme binding protein  68.97 
 
 		 177 aa  251  3e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003158  guanylate cyclase-related protein  53.98 
 
 		 179 aa  202  2e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01911  hypothetical protein  52.46 
 
 		 186 aa  202  2e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11538  putative guanylate cyclase-related protein  40.68 
 
 		 179 aa  142  3e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00897184  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6271  Heme NO binding domain protein  40.34 
 
 		 179 aa  137  8.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2751  heme NO binding domain-containing protein  34.83 
 
 		 182 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25984  normal  0.023799 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3098  Guanylate cyclase-related protein  32.6 
 
 		 183 aa  118  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0133241  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1532  4-vinyl reductase, 4VR  35.8 
 
 		 181 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4397  heme NO binding domain-containing protein  34.44 
 
 		 181 aa  106  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0582827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4860  Heme NO binding domain protein  34.64 
 
 		 181 aa  106  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.487803  normal  0.0981088 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1053  hypothetical protein  33.87 
 
 		 180 aa  105  4e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1373  Heme NO binding domain protein  30.99 
 
 		 182 aa  103  9e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.305689 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2325  hypothetical protein  33.33 
 
 		 180 aa  103  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5547  Heme NO binding domain protein  37.34 
 
 		 180 aa  101  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2525  hypothetical protein  34.27 
 
 		 184 aa  101  6e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3609  hypothetical protein  33.12 
 
 		 184 aa  100  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2746  heme NO binding domain-containing protein  33.54 
 
 		 184 aa  99  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.463367  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2378  hypothetical protein  33.71 
 
 		 184 aa  97.8  6e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0659  hypothetical protein  36.65 
 
 		 191 aa  95.9  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00493  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  30.32 
 
 		 179 aa  86.7  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.202903  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3804  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  32.92 
 
 		 180 aa  85.5  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3557  hypothetical protein  26.88 
 
 		 182 aa  74.3  0.0000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.566372 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2144  hypothetical protein  25.79 
 
 		 181 aa  71.2  0.000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2084  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.97 
 
 		 597 aa  65.5  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0470  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  22.99 
 
 		 701 aa  52.8  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0387298 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2675  Heme NO binding domain protein  23.12 
 
 		 189 aa  48.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21990  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.69 
 
 		 604 aa  46.2  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>