30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003158 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003158  guanylate cyclase-related protein  100 
 
 		 179 aa  371  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01911  hypothetical protein  82.26 
 
 		 186 aa  319  9.999999999999999e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1013  putative heme binding protein  60.89 
 
 		 177 aa  226  1e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1754  hypothetical protein  53.98 
 
 		 177 aa  202  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.213928 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6271  Heme NO binding domain protein  40.34 
 
 		 179 aa  135  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11538  putative guanylate cyclase-related protein  35.96 
 
 		 179 aa  127  8.000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00897184  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2751  heme NO binding domain-containing protein  38.01 
 
 		 182 aa  124  6e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25984  normal  0.023799 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3098  Guanylate cyclase-related protein  33.71 
 
 		 183 aa  117  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0133241  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1532  4-vinyl reductase, 4VR  38.95 
 
 		 181 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5547  Heme NO binding domain protein  36.36 
 
 		 180 aa  103  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2325  hypothetical protein  37.2 
 
 		 180 aa  98.6  4e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2525  hypothetical protein  32.96 
 
 		 184 aa  97.8  8e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1053  hypothetical protein  36.81 
 
 		 180 aa  96.3  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2746  heme NO binding domain-containing protein  32.56 
 
 		 184 aa  95.1  5e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.463367  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2378  hypothetical protein  32.4 
 
 		 184 aa  95.1  5e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3609  hypothetical protein  31.71 
 
 		 184 aa  93.2  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4860  Heme NO binding domain protein  33.89 
 
 		 181 aa  91.3  8e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.487803  normal  0.0981088 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4397  heme NO binding domain-containing protein  31.67 
 
 		 181 aa  90.9  9e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0582827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0659  hypothetical protein  35.19 
 
 		 191 aa  89  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1373  Heme NO binding domain protein  28.4 
 
 		 182 aa  87.8  7e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.305689 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00493  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  35.03 
 
 		 179 aa  87  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.202903  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3804  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  33.97 
 
 		 180 aa  85.9  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3557  hypothetical protein  25.61 
 
 		 182 aa  69.3  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.566372 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2084  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.32 
 
 		 597 aa  63.9  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2144  hypothetical protein  25.73 
 
 		 181 aa  62  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21990  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.76 
 
 		 604 aa  52.4  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0549  heme NO binding domain-containing protein  22.36 
 
 		 417 aa  50.8  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.197755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1633  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.73 
 
 		 604 aa  50.1  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0470  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  20.45 
 
 		 701 aa  46.6  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0387298 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1752  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.43 
 
 		 897 aa  45.1  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.10138  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>