26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_11538 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_11538  putative guanylate cyclase-related protein  100 
 
 
179 aa  352  1e-96  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00897184  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6271  Heme NO binding domain protein  43.02 
 
 
179 aa  155  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1754  hypothetical protein  40.68 
 
 
177 aa  142  3e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.213928 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3098  Guanylate cyclase-related protein  38.25 
 
 
183 aa  138  4.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0133241  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1013  putative heme binding protein  39.66 
 
 
177 aa  137  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01911  hypothetical protein  36.76 
 
 
186 aa  134  8e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2525  hypothetical protein  41.11 
 
 
184 aa  130  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003158  guanylate cyclase-related protein  35.96 
 
 
179 aa  127  8.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2378  hypothetical protein  40 
 
 
184 aa  127  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2751  heme NO binding domain-containing protein  36.87 
 
 
182 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25984  normal  0.023799 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00493  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  37.11 
 
 
179 aa  120  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.202903  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1053  hypothetical protein  33.75 
 
 
180 aa  111  6e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2325  hypothetical protein  34.19 
 
 
180 aa  110  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4860  Heme NO binding domain protein  34.64 
 
 
181 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.487803  normal  0.0981088 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4397  heme NO binding domain-containing protein  35.2 
 
 
181 aa  107  9.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0582827  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2746  heme NO binding domain-containing protein  33.33 
 
 
184 aa  107  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.463367  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3609  hypothetical protein  32.02 
 
 
184 aa  105  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1532  4-vinyl reductase, 4VR  30.77 
 
 
181 aa  100  9e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1373  Heme NO binding domain protein  27.81 
 
 
182 aa  94.4  9e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.305689 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5547  Heme NO binding domain protein  27.49 
 
 
180 aa  82.8  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0659  hypothetical protein  33.75 
 
 
191 aa  83.2  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3804  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  26.97 
 
 
180 aa  80.1  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2144  hypothetical protein  22.73 
 
 
181 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2084  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.29 
 
 
597 aa  59.7  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3557  hypothetical protein  20.71 
 
 
182 aa  50.1  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.566372 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1633  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.36 
 
 
604 aa  41.2  0.008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>