31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4397 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4397  heme NO binding domain-containing protein  100 
 
 		 181 aa  368  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0582827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4860  Heme NO binding domain protein  98.9 
 
 		 181 aa  363  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.487803  normal  0.0981088 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3098  Guanylate cyclase-related protein  50.28 
 
 		 183 aa  167  5e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0133241  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2525  hypothetical protein  38.86 
 
 		 184 aa  139  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2378  hypothetical protein  37.85 
 
 		 184 aa  135  2e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6271  Heme NO binding domain protein  40.61 
 
 		 179 aa  134  8e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11538  putative guanylate cyclase-related protein  35.2 
 
 		 179 aa  125  4.0000000000000003e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00897184  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2751  heme NO binding domain-containing protein  35 
 
 		 182 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25984  normal  0.023799 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1053  hypothetical protein  37.04 
 
 		 180 aa  121  5e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2325  hypothetical protein  37.04 
 
 		 180 aa  120  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00493  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  40.65 
 
 		 179 aa  119  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.202903  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2746  heme NO binding domain-containing protein  39.44 
 
 		 184 aa  119  3e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.463367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1013  putative heme binding protein  33.71 
 
 		 177 aa  114  6e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1754  hypothetical protein  34.64 
 
 		 177 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.213928 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3804  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  33.15 
 
 		 180 aa  111  5e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5547  Heme NO binding domain protein  39.23 
 
 		 180 aa  110  9e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1373  Heme NO binding domain protein  36.72 
 
 		 182 aa  107  7.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.305689 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0659  hypothetical protein  37.04 
 
 		 191 aa  103  9e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003158  guanylate cyclase-related protein  33.89 
 
 		 179 aa  103  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01911  hypothetical protein  31.55 
 
 		 186 aa  103  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3609  hypothetical protein  33.54 
 
 		 184 aa  98.6  5e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1532  4-vinyl reductase, 4VR  33.53 
 
 		 181 aa  95.9  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2144  hypothetical protein  28.57 
 
 		 181 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3557  hypothetical protein  27.54 
 
 		 182 aa  75.5  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.566372 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2084  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.93 
 
 		 597 aa  62.8  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0470  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  28.25 
 
 		 701 aa  55.5  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0387298 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1633  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  20.25 
 
 		 604 aa  50.4  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1766  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.32 
 
 		 605 aa  49.7  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.053685  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0170  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  21.91 
 
 		 604 aa  47.8  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000484425  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2675  Heme NO binding domain protein  24.18 
 
 		 189 aa  44.7  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1752  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.84 
 
 		 897 aa  44.7  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.10138  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>