29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2751 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2751  heme NO binding domain-containing protein  100 
 
 		 182 aa  372  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25984  normal  0.023799 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6271  Heme NO binding domain protein  41.11 
 
 		 179 aa  150  8e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1754  hypothetical protein  34.83 
 
 		 177 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.213928 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3804  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  38.98 
 
 		 180 aa  129  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01911  hypothetical protein  37.85 
 
 		 186 aa  127  7.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11538  putative guanylate cyclase-related protein  36.87 
 
 		 179 aa  125  5e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00897184  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003158  guanylate cyclase-related protein  38.01 
 
 		 179 aa  124  6e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1013  putative heme binding protein  33.93 
 
 		 177 aa  124  8.000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2525  hypothetical protein  34.44 
 
 		 184 aa  120  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4860  Heme NO binding domain protein  35 
 
 		 181 aa  118  6e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.487803  normal  0.0981088 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2378  hypothetical protein  33.89 
 
 		 184 aa  117  9e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4397  heme NO binding domain-containing protein  35 
 
 		 181 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0582827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0659  hypothetical protein  37.04 
 
 		 191 aa  108  6e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2746  heme NO binding domain-containing protein  34.05 
 
 		 184 aa  108  6e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.463367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1532  4-vinyl reductase, 4VR  32.96 
 
 		 181 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3098  Guanylate cyclase-related protein  34.83 
 
 		 183 aa  107  8.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0133241  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00493  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  36.13 
 
 		 179 aa  105  5e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.202903  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1373  Heme NO binding domain protein  31.74 
 
 		 182 aa  102  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.305689 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1053  hypothetical protein  35.58 
 
 		 180 aa  100  9e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3609  hypothetical protein  34.55 
 
 		 184 aa  100  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2325  hypothetical protein  34.97 
 
 		 180 aa  99.4  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5547  Heme NO binding domain protein  34.78 
 
 		 180 aa  92.8  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2144  hypothetical protein  32.1 
 
 		 181 aa  90.5  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3557  hypothetical protein  24.69 
 
 		 182 aa  67.8  0.00000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.566372 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2675  Heme NO binding domain protein  24.86 
 
 		 189 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2084  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  20.83 
 
 		 597 aa  48.5  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2264  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  21.89 
 
 		 604 aa  47  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0470  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  22.94 
 
 		 701 aa  46.6  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0387298 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1630  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  21.18 
 
 		 605 aa  41.6  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00337409  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>