29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0659 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0659  hypothetical protein  100 
 
 		 191 aa  400  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3609  hypothetical protein  49.16 
 
 		 184 aa  186  2e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3804  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  42.22 
 
 		 180 aa  152  4e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2144  hypothetical protein  35.2 
 
 		 181 aa  135  4e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5547  Heme NO binding domain protein  38.42 
 
 		 180 aa  130  7.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2325  hypothetical protein  39.23 
 
 		 180 aa  130  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1053  hypothetical protein  37.99 
 
 		 180 aa  130  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1532  4-vinyl reductase, 4VR  38.98 
 
 		 181 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1373  Heme NO binding domain protein  32.97 
 
 		 182 aa  114  6e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.305689 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3557  hypothetical protein  32.77 
 
 		 182 aa  108  6e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.566372 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2751  heme NO binding domain-containing protein  37.04 
 
 		 182 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25984  normal  0.023799 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6271  Heme NO binding domain protein  34.71 
 
 		 179 aa  101  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1754  hypothetical protein  36.65 
 
 		 177 aa  95.9  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.213928 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4860  Heme NO binding domain protein  37.04 
 
 		 181 aa  95.9  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.487803  normal  0.0981088 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4397  heme NO binding domain-containing protein  37.04 
 
 		 181 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0582827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3098  Guanylate cyclase-related protein  33.33 
 
 		 183 aa  93.2  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0133241  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01911  hypothetical protein  32.54 
 
 		 186 aa  92  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003158  guanylate cyclase-related protein  35.19 
 
 		 179 aa  89  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1013  putative heme binding protein  33.75 
 
 		 177 aa  84.7  7e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00493  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  33.55 
 
 		 179 aa  83.6  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.202903  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2525  hypothetical protein  33.33 
 
 		 184 aa  83.2  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11538  putative guanylate cyclase-related protein  33.75 
 
 		 179 aa  83.2  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00897184  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2378  hypothetical protein  32.72 
 
 		 184 aa  79.3  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2746  heme NO binding domain-containing protein  29.75 
 
 		 184 aa  75.1  0.0000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.463367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0470  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  27.5 
 
 		 701 aa  59.3  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0387298 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2675  Heme NO binding domain protein  25.39 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21990  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.22 
 
 		 604 aa  48.1  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1752  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.41 
 
 		 897 aa  45.4  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.10138  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0170  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.37 
 
 		 604 aa  43.9  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000484425  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>