27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3098 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3098  Guanylate cyclase-related protein  100 
 
 		 183 aa  366  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0133241  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4397  heme NO binding domain-containing protein  50.28 
 
 		 181 aa  151  4e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0582827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4860  Heme NO binding domain protein  49.72 
 
 		 181 aa  149  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.487803  normal  0.0981088 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11538  putative guanylate cyclase-related protein  38.25 
 
 		 179 aa  138  4.999999999999999e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00897184  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6271  Heme NO binding domain protein  40.22 
 
 		 179 aa  136  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2525  hypothetical protein  36.07 
 
 		 184 aa  127  9.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2378  hypothetical protein  35.52 
 
 		 184 aa  121  5e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00493  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  37.87 
 
 		 179 aa  120  8e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.202903  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1754  hypothetical protein  32.6 
 
 		 177 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.213928 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003158  guanylate cyclase-related protein  33.71 
 
 		 179 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1013  putative heme binding protein  33.52 
 
 		 177 aa  114  8.999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01911  hypothetical protein  32.97 
 
 		 186 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1373  Heme NO binding domain protein  36.46 
 
 		 182 aa  111  5e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.305689 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1053  hypothetical protein  34.78 
 
 		 180 aa  111  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2325  hypothetical protein  34.78 
 
 		 180 aa  111  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2751  heme NO binding domain-containing protein  34.83 
 
 		 182 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25984  normal  0.023799 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1532  4-vinyl reductase, 4VR  35.75 
 
 		 181 aa  106  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3804  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  36.63 
 
 		 180 aa  100  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2746  heme NO binding domain-containing protein  37.95 
 
 		 184 aa  99.4  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.463367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5547  Heme NO binding domain protein  36.59 
 
 		 180 aa  95.5  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3609  hypothetical protein  34.15 
 
 		 184 aa  95.5  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0659  hypothetical protein  33.33 
 
 		 191 aa  93.2  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3557  hypothetical protein  33.33 
 
 		 182 aa  73.2  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.566372 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2144  hypothetical protein  26.63 
 
 		 181 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1633  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.01 
 
 		 604 aa  62  0.000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2084  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.08 
 
 		 597 aa  58.5  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21990  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.42 
 
 		 604 aa  43.1  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>