33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl1053 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl1053  hypothetical protein  100 
 
 
180 aa  378  1e-104  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2325  hypothetical protein  96.11 
 
 
180 aa  365  1e-100  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3609  hypothetical protein  40.56 
 
 
184 aa  155  4e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6271  Heme NO binding domain protein  44.58 
 
 
179 aa  149  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5547  Heme NO binding domain protein  38.55 
 
 
180 aa  139  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3804  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  37.85 
 
 
180 aa  137  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0659  hypothetical protein  37.99 
 
 
191 aa  130  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2144  hypothetical protein  35.56 
 
 
181 aa  127  9.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1532  4-vinyl reductase, 4VR  35.39 
 
 
181 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2525  hypothetical protein  34.27 
 
 
184 aa  112  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11538  putative guanylate cyclase-related protein  33.75 
 
 
179 aa  111  6e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00897184  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3098  Guanylate cyclase-related protein  34.78 
 
 
183 aa  111  6e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0133241  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4860  Heme NO binding domain protein  36.42 
 
 
181 aa  111  6e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.487803  normal  0.0981088 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3557  hypothetical protein  35.59 
 
 
182 aa  111  7.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.566372 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4397  heme NO binding domain-containing protein  37.04 
 
 
181 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0582827  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2378  hypothetical protein  32.58 
 
 
184 aa  107  9.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1754  hypothetical protein  33.87 
 
 
177 aa  105  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.213928 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1373  Heme NO binding domain protein  30.56 
 
 
182 aa  103  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.305689 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00493  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  34.3 
 
 
179 aa  101  5e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.202903  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2751  heme NO binding domain-containing protein  35.58 
 
 
182 aa  100  9e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25984  normal  0.023799 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003158  guanylate cyclase-related protein  36.81 
 
 
179 aa  96.3  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01911  hypothetical protein  32.16 
 
 
186 aa  89.7  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1013  putative heme binding protein  31.87 
 
 
177 aa  89.4  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2746  heme NO binding domain-containing protein  34.81 
 
 
184 aa  88.6  4e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.463367  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1752  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.67 
 
 
897 aa  65.1  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.10138  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2675  Heme NO binding domain protein  25.14 
 
 
189 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2084  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.89 
 
 
597 aa  62.4  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0470  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  24.44 
 
 
701 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0387298 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1633  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  21.52 
 
 
604 aa  53.5  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0549  heme NO binding domain-containing protein  20.99 
 
 
417 aa  50.1  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.197755  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21990  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.22 
 
 
604 aa  45.4  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1630  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.14 
 
 
605 aa  43.1  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00337409  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2815  hypothetical protein  22.52 
 
 
194 aa  42.4  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.174308 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>