29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl2378 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl2378  hypothetical protein  100 
 
 
184 aa  382  1e-105  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2525  hypothetical protein  97.83 
 
 
184 aa  374  1e-103  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6271  Heme NO binding domain protein  43.02 
 
 
179 aa  145  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11538  putative guanylate cyclase-related protein  40 
 
 
179 aa  127  1.0000000000000001e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00897184  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4860  Heme NO binding domain protein  38.86 
 
 
181 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.487803  normal  0.0981088 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4397  heme NO binding domain-containing protein  37.85 
 
 
181 aa  122  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0582827  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3098  Guanylate cyclase-related protein  35.52 
 
 
183 aa  121  5e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0133241  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2751  heme NO binding domain-containing protein  33.89 
 
 
182 aa  117  9e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25984  normal  0.023799 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1053  hypothetical protein  32.58 
 
 
180 aa  107  9.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2325  hypothetical protein  32.02 
 
 
180 aa  106  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1754  hypothetical protein  33.71 
 
 
177 aa  97.8  7e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.213928 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1013  putative heme binding protein  32.78 
 
 
177 aa  96.7  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01911  hypothetical protein  32.26 
 
 
186 aa  95.5  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003158  guanylate cyclase-related protein  32.4 
 
 
179 aa  95.1  5e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00493  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  32.32 
 
 
179 aa  94.4  8e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.202903  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3804  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  31.87 
 
 
180 aa  92  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5547  Heme NO binding domain protein  31.87 
 
 
180 aa  87.8  8e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1532  4-vinyl reductase, 4VR  31.87 
 
 
181 aa  85.9  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2746  heme NO binding domain-containing protein  29.51 
 
 
184 aa  82  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.463367  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1373  Heme NO binding domain protein  34.23 
 
 
182 aa  80.9  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.305689 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0659  hypothetical protein  32.72 
 
 
191 aa  79.3  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2144  hypothetical protein  27.5 
 
 
181 aa  77  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3609  hypothetical protein  28.09 
 
 
184 aa  77  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3557  hypothetical protein  25.62 
 
 
182 aa  70.5  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.566372 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21990  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.18 
 
 
604 aa  54.7  0.0000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2084  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.12 
 
 
597 aa  47.4  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1752  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.47 
 
 
897 aa  47  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.10138  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0470  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  22.48 
 
 
701 aa  41.6  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0387298 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2264  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  20.75 
 
 
604 aa  41.2  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>