25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05818 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05818  extracellular lipase  100 
 
 
826 aa  1674    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0373  putative lipase  36.44 
 
 
796 aa  434  1e-120  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000184  putative lipase  37.07 
 
 
802 aa  426  1e-117  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00112998  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1192  hypothetical protein  29.02 
 
 
866 aa  220  8.999999999999998e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2934  hypothetical protein  27.22 
 
 
827 aa  205  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2791  hypothetical protein  27.81 
 
 
827 aa  206  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000777581  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2714  hypothetical protein  27.81 
 
 
827 aa  206  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000160154  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1673  hypothetical protein  27.59 
 
 
827 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000708466  hitchhiker  0.00599619 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2693  hypothetical protein  27.7 
 
 
827 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000315404  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2182  hypothetical protein  28.64 
 
 
872 aa  192  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000870738  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1535  hypothetical protein  27.46 
 
 
828 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000356269  hitchhiker  0.00903713 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1529  hypothetical protein  27.37 
 
 
828 aa  191  5e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00333125  hitchhiker  0.00000000514631 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1469  hypothetical protein  27.74 
 
 
827 aa  190  9e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000892624  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2408  hypothetical protein  27.5 
 
 
828 aa  187  5e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0178589  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1650  hypothetical protein  26.12 
 
 
832 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000305835  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01894  hypothetical protein  27.77 
 
 
856 aa  170  9e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.128925  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2120  hypothetical protein  27.76 
 
 
826 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000487086  normal  0.788805 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2472  hypothetical protein  26.95 
 
 
839 aa  161  4e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00113127  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2571  hypothetical protein  27.43 
 
 
829 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1693  hypothetical protein  28.38 
 
 
828 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000331771  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2904  hypothetical protein  28.38 
 
 
823 aa  124  7e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000289565  normal  0.061749 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2395  hypothetical protein  25.96 
 
 
824 aa  114  8.000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000022798  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1215  MECDP-synthase  26.1 
 
 
993 aa  69.7  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000222829  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2036  hypothetical protein  25.54 
 
 
939 aa  56.2  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0890  hypothetical protein  28.42 
 
 
832 aa  50.4  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0004283  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>