29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2571 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2934  hypothetical protein  74.19 
 
 		 827 aa  1226    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1673  hypothetical protein  76 
 
 		 827 aa  1246    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000708466  hitchhiker  0.00599619 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2904  hypothetical protein  68.22 
 
 		 823 aa  1093    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000289565  normal  0.061749 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2791  hypothetical protein  76.24 
 
 		 827 aa  1250    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000777581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1650  hypothetical protein  63.35 
 
 		 832 aa  997    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000305835  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1693  hypothetical protein  67.9 
 
 		 828 aa  1097    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000331771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2714  hypothetical protein  76.24 
 
 		 827 aa  1250    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000160154  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2395  hypothetical protein  73.58 
 
 		 824 aa  1157    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000022798  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2408  hypothetical protein  69.75 
 
 		 828 aa  1140    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0178589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2693  hypothetical protein  76.24 
 
 		 827 aa  1251    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000315404  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2120  hypothetical protein  71.84 
 
 		 826 aa  1123    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000487086  normal  0.788805 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1529  hypothetical protein  74.37 
 
 		 828 aa  1186    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00333125  hitchhiker  0.00000000514631 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2571  hypothetical protein  100 
 
 		 829 aa  1660    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1535  hypothetical protein  74.13 
 
 		 828 aa  1184    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000356269  hitchhiker  0.00903713 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1469  hypothetical protein  75.3 
 
 		 827 aa  1211    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000892624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2472  hypothetical protein  69.81 
 
 		 839 aa  1134    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00113127  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1192  hypothetical protein  42.94 
 
 		 866 aa  577  1.0000000000000001e-163  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2182  hypothetical protein  33.84 
 
 		 872 aa  327  5e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000870738  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01894  hypothetical protein  34.94 
 
 		 856 aa  310  5e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.128925  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000184  putative lipase  28.1 
 
 		 802 aa  199  1.0000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00112998  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0373  putative lipase  27.64 
 
 		 796 aa  187  5e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05818  extracellular lipase  28.34 
 
 		 826 aa  180  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1215  MECDP-synthase  26.98 
 
 		 993 aa  98.6  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000222829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2036  hypothetical protein  28.97 
 
 		 939 aa  77.4  0.0000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0034  hypothetical protein  26.87 
 
 		 975 aa  59.3  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.272533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0890  hypothetical protein  27.92 
 
 		 832 aa  50.4  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0004283  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0048  hypothetical protein  28.16 
 
 		 982 aa  47  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0033  hypothetical protein  30.06 
 
 		 982 aa  45.8  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.116472  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0036  hypothetical protein  28.24 
 
 		 982 aa  45.4  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>