29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_1535 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_2934  hypothetical protein  91.79 
 
 
827 aa  1548    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1673  hypothetical protein  89.73 
 
 
827 aa  1507    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000708466  hitchhiker  0.00599619 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2904  hypothetical protein  70.45 
 
 
823 aa  1135    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000289565  normal  0.061749 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2791  hypothetical protein  89.86 
 
 
827 aa  1508    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000777581  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1650  hypothetical protein  62.42 
 
 
832 aa  1015    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000305835  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1693  hypothetical protein  70.45 
 
 
828 aa  1160    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000331771  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2714  hypothetical protein  89.86 
 
 
827 aa  1508    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000160154  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2395  hypothetical protein  88.29 
 
 
824 aa  1430    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000022798  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2408  hypothetical protein  73.95 
 
 
828 aa  1223    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0178589  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2693  hypothetical protein  90.1 
 
 
827 aa  1513    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000315404  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2120  hypothetical protein  71.46 
 
 
826 aa  1144    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000487086  normal  0.788805 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1529  hypothetical protein  98.19 
 
 
828 aa  1651    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00333125  hitchhiker  0.00000000514631 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2571  hypothetical protein  74.13 
 
 
829 aa  1121    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1535  hypothetical protein  100 
 
 
828 aa  1678    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000356269  hitchhiker  0.00903713 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1469  hypothetical protein  97.71 
 
 
827 aa  1600    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000892624  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2472  hypothetical protein  66.63 
 
 
839 aa  1098    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00113127  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1192  hypothetical protein  41.48 
 
 
866 aa  566  1e-160  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01894  hypothetical protein  33.55 
 
 
856 aa  306  8.000000000000001e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.128925  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2182  hypothetical protein  30.32 
 
 
872 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000870738  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0373  putative lipase  28.46 
 
 
796 aa  217  5.9999999999999996e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05818  extracellular lipase  27.56 
 
 
826 aa  201  3.9999999999999996e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000184  putative lipase  26.41 
 
 
802 aa  179  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00112998  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1215  MECDP-synthase  27.07 
 
 
993 aa  100  8e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000222829  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2036  hypothetical protein  29.92 
 
 
939 aa  70.1  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0034  hypothetical protein  26.52 
 
 
975 aa  61.2  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.272533  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0890  hypothetical protein  27.92 
 
 
832 aa  58.2  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0004283  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0048  hypothetical protein  29.48 
 
 
982 aa  53.9  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0036  hypothetical protein  25 
 
 
982 aa  53.5  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0033  hypothetical protein  26.9 
 
 
982 aa  51.6  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.116472  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>