25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0890 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_0890  hypothetical protein  100 
 
 
832 aa  1643    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0004283  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2182  hypothetical protein  31.69 
 
 
872 aa  82.8  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000870738  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2408  hypothetical protein  25.42 
 
 
828 aa  75.1  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0178589  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0373  putative lipase  31.07 
 
 
796 aa  75.1  0.000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01894  hypothetical protein  30.77 
 
 
856 aa  70.9  0.00000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.128925  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1192  hypothetical protein  29.9 
 
 
866 aa  67  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2036  hypothetical protein  33.07 
 
 
939 aa  65.1  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1673  hypothetical protein  28.33 
 
 
827 aa  63.9  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000708466  hitchhiker  0.00599619 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2791  hypothetical protein  28.38 
 
 
827 aa  62.8  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000777581  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2714  hypothetical protein  28.38 
 
 
827 aa  62.8  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000160154  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2693  hypothetical protein  28.38 
 
 
827 aa  62.4  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000315404  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2934  hypothetical protein  27.22 
 
 
827 aa  60.8  0.00000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000184  putative lipase  30.81 
 
 
802 aa  60.5  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00112998  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1650  hypothetical protein  34.12 
 
 
832 aa  59.3  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000305835  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1529  hypothetical protein  29.51 
 
 
828 aa  57.4  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00333125  hitchhiker  0.00000000514631 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1535  hypothetical protein  29.51 
 
 
828 aa  57.4  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000356269  hitchhiker  0.00903713 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0033  hypothetical protein  27.54 
 
 
982 aa  55.8  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.116472  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1469  hypothetical protein  30.27 
 
 
827 aa  55.1  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000892624  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05818  extracellular lipase  27.65 
 
 
826 aa  55.1  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2904  hypothetical protein  27.97 
 
 
823 aa  54.7  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000289565  normal  0.061749 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0036  hypothetical protein  26.32 
 
 
982 aa  53.5  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0048  hypothetical protein  26.01 
 
 
982 aa  53.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2395  hypothetical protein  30.13 
 
 
824 aa  50.8  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000022798  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1215  MECDP-synthase  24.73 
 
 
993 aa  49.7  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000222829  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2472  hypothetical protein  27.74 
 
 
839 aa  48.1  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00113127  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>