22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0572 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0572  hypothetical protein  100 
 
 		 346 aa  667    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0720  putative ammonia monooxygenase  34.53 
 
 		 347 aa  125  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.716088  normal  0.227545 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2134  putative ammonia monooxygenase  32.15 
 
 		 339 aa  122  7e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2727  putative ammonia monooxygenase  30.17 
 
 		 342 aa  102  7e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0543  membrane protein AbrB duplication  27.92 
 
 		 350 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0495  putative ammonia monooxygenase  27.87 
 
 		 359 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.255984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0330  putative ammonia monooxygenase  27.3 
 
 		 359 aa  75.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.328581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0301  putative ammonia monooxygenase  26.19 
 
 		 367 aa  73.9  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0363814 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1096  hypothetical protein  26.26 
 
 		 361 aa  68.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.402097  normal  0.189814 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0324  putative ammonia monooxygenase  24.91 
 
 		 343 aa  63.2  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1276  membrane protein AbrB duplication  26.86 
 
 		 355 aa  62  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0626  putative ammonia monooxygenase  24.72 
 
 		 354 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.124772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2088  putative ammonia monooxygenase  27.66 
 
 		 338 aa  58.9  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.813317  normal  0.649237 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4953  putative ammonia monooxygenase  26.2 
 
 		 356 aa  52.8  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.365328  normal  0.422163 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1723  putative ammonia monooxygenase  25.27 
 
 		 357 aa  48.1  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1757  putative ammonia monooxygenase  25.27 
 
 		 357 aa  48.1  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1230  hypothetical protein  21.74 
 
 		 355 aa  48.1  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.180741  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1995  putative ammonia monooxygenase  23.21 
 
 		 362 aa  47  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.212349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1961  putative ammonia monooxygenase  24.22 
 
 		 369 aa  46.6  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.959619  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0952  membrane protein AbrB duplication  22.97 
 
 		 389 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1117  membrane protein AbrB duplication  26.91 
 
 		 364 aa  43.1  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_7367  AbrB protein (AidB regulator)  25.09 
 
 		 354 aa  42.7  0.01  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>