27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0350 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0350  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  281  2.0000000000000002e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4484  hypothetical protein  47.01 
 
 		 137 aa  107  6e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.38663  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2924  CGLD9; hypothetical protein  49.22 
 
 		 118 aa  102  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000992549  hitchhiker  0.0000308384 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0459  putative transmembrane protein  39.68 
 
 		 129 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.647945 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0157  putative transmembrane protein  46.02 
 
 		 127 aa  89  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0167  putative transmembrane protein  45.13 
 
 		 127 aa  87.4  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0176  putative transmembrane protein  45.13 
 
 		 127 aa  87.4  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3725  hypothetical protein  45.24 
 
 		 127 aa  78.2  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3912  putative transmembrane protein  42.28 
 
 		 127 aa  76.6  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.116991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10406  transmembrane protein  38.21 
 
 		 123 aa  70.9  0.000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0193  putative transmembrane protein  38.21 
 
 		 148 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.580354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25040  hypothetical protein  35.61 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2206  hypothetical protein  38.98 
 
 		 138 aa  67.8  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00274639  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0483  hypothetical protein  38.66 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0794  hypothetical protein  37.82 
 
 		 123 aa  60.8  0.000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.332572  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13960  hypothetical protein  35.59 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.735929 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0289  hypothetical protein  31.11 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.723479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1060  hypothetical protein  50 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0888  hypothetical protein  32.84 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2784  hypothetical protein  38.46 
 
 		 144 aa  50.8  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4543  hypothetical protein  33.33 
 
 		 136 aa  47  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22010  hypothetical protein  38.68 
 
 		 142 aa  47  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.186895  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1943  hypothetical protein  32.5 
 
 		 144 aa  44.3  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000376833 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15399  predicted protein  33.87 
 
 		 176 aa  43.1  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.581313  normal  0.681508 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12090  hypothetical protein  35.92 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0468866  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1772  hypothetical protein  32.03 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.019002  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2730  putative transmembrane protein  33.33 
 
 		 138 aa  40.4  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137333  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>