23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2730 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2730  putative transmembrane protein  100 
 
 
138 aa  246  1e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137333  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0459  putative transmembrane protein  46.56 
 
 
129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.647945 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0167  putative transmembrane protein  53.77 
 
 
127 aa  111  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0176  putative transmembrane protein  53.77 
 
 
127 aa  111  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0157  putative transmembrane protein  53.77 
 
 
127 aa  110  5e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0483  hypothetical protein  49.07 
 
 
124 aa  103  7e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0193  putative transmembrane protein  54.55 
 
 
148 aa  99.4  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.580354  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3725  hypothetical protein  50.96 
 
 
127 aa  96.3  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10406  transmembrane protein  53 
 
 
123 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2206  hypothetical protein  45.28 
 
 
138 aa  89.7  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00274639  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3912  putative transmembrane protein  46.23 
 
 
127 aa  86.7  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.116991  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2924  CGLD9; hypothetical protein  47.9 
 
 
118 aa  82.4  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000992549  hitchhiker  0.0000308384 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0888  hypothetical protein  41.88 
 
 
129 aa  80.1  0.000000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13960  hypothetical protein  44.35 
 
 
132 aa  73.2  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.735929 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0350  hypothetical protein  34.4 
 
 
146 aa  71.6  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25040  hypothetical protein  40.48 
 
 
144 aa  71.2  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4484  hypothetical protein  31.86 
 
 
137 aa  70.9  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.38663  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0794  hypothetical protein  40.54 
 
 
123 aa  68.2  0.00000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.332572  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1943  hypothetical protein  44.07 
 
 
144 aa  66.2  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000376833 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4543  hypothetical protein  44.66 
 
 
136 aa  63.9  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1060  hypothetical protein  47.44 
 
 
121 aa  62  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22010  hypothetical protein  46.46 
 
 
142 aa  61.2  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.186895  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0404  hypothetical protein  33.86 
 
 
138 aa  41.2  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>