20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_13960 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_13960  hypothetical protein  100 
 
 
132 aa  249  9.000000000000001e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.735929 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0459  putative transmembrane protein  48.8 
 
 
129 aa  94.7  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.647945 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0167  putative transmembrane protein  49.52 
 
 
127 aa  90.5  8e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0176  putative transmembrane protein  49.52 
 
 
127 aa  90.5  8e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0157  putative transmembrane protein  49.52 
 
 
127 aa  90.1  9e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2206  hypothetical protein  43.2 
 
 
138 aa  79.7  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00274639  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0193  putative transmembrane protein  47.71 
 
 
148 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.580354  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10406  transmembrane protein  44.64 
 
 
123 aa  73.6  0.0000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2924  CGLD9; hypothetical protein  40.83 
 
 
118 aa  68.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000992549  hitchhiker  0.0000308384 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4484  hypothetical protein  37.72 
 
 
137 aa  68.6  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.38663  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0350  hypothetical protein  35.59 
 
 
146 aa  66.6  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3912  putative transmembrane protein  43.4 
 
 
127 aa  65.5  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.116991  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3725  hypothetical protein  40.54 
 
 
127 aa  64.3  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0483  hypothetical protein  44.79 
 
 
124 aa  63.9  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25040  hypothetical protein  40.52 
 
 
144 aa  63.5  0.0000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1943  hypothetical protein  45.71 
 
 
144 aa  61.6  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000376833 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0794  hypothetical protein  39 
 
 
123 aa  58.5  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.332572  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0888  hypothetical protein  35.09 
 
 
129 aa  51.2  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4543  hypothetical protein  37.36 
 
 
136 aa  49.7  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2730  putative transmembrane protein  46 
 
 
138 aa  43.9  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137333  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>