22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_25040 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_25040  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  266  8e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4543  hypothetical protein  46.55 
 
 		 136 aa  84.7  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0459  putative transmembrane protein  43.22 
 
 		 129 aa  80.1  0.000000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.647945 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0193  putative transmembrane protein  42.98 
 
 		 148 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.580354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2206  hypothetical protein  44.44 
 
 		 138 aa  75.1  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00274639  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0888  hypothetical protein  36.07 
 
 		 129 aa  75.1  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0350  hypothetical protein  36.62 
 
 		 146 aa  73.2  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2924  CGLD9; hypothetical protein  42.74 
 
 		 118 aa  70.5  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000992549  hitchhiker  0.0000308384 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3912  putative transmembrane protein  37.82 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.116991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0157  putative transmembrane protein  36.44 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13960  hypothetical protein  40.6 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.735929 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0167  putative transmembrane protein  36.44 
 
 		 127 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0176  putative transmembrane protein  36.44 
 
 		 127 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4484  hypothetical protein  33.33 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.38663  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3725  hypothetical protein  39.17 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0483  hypothetical protein  37.3 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10406  transmembrane protein  39.13 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0794  hypothetical protein  33.6 
 
 		 123 aa  50.8  0.000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.332572  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1943  hypothetical protein  38.94 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000376833 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2730  putative transmembrane protein  39.13 
 
 		 138 aa  42  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1772  hypothetical protein  31.65 
 
 		 129 aa  41.2  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.019002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22010  hypothetical protein  30.84 
 
 		 142 aa  40.4  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.186895  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>