21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0794 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0794  hypothetical protein  100 
 
 
123 aa  231  2.0000000000000002e-60  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.332572  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2206  hypothetical protein  45.95 
 
 
138 aa  76.3  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00274639  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0167  putative transmembrane protein  46.81 
 
 
127 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0176  putative transmembrane protein  46.81 
 
 
127 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4484  hypothetical protein  42.59 
 
 
137 aa  73.9  0.0000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.38663  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0459  putative transmembrane protein  38.18 
 
 
129 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.647945 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0157  putative transmembrane protein  45.74 
 
 
127 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10406  transmembrane protein  41.44 
 
 
123 aa  70.1  0.000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3725  hypothetical protein  45.19 
 
 
127 aa  68.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0193  putative transmembrane protein  41.41 
 
 
148 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.580354  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2924  CGLD9; hypothetical protein  40.91 
 
 
118 aa  61.2  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000992549  hitchhiker  0.0000308384 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0350  hypothetical protein  37.82 
 
 
146 aa  60.8  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0888  hypothetical protein  33.07 
 
 
129 aa  60.1  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0483  hypothetical protein  42.22 
 
 
124 aa  58.2  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13960  hypothetical protein  37.93 
 
 
132 aa  55.1  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.735929 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3912  putative transmembrane protein  39.56 
 
 
127 aa  54.7  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.116991  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25040  hypothetical protein  33.6 
 
 
144 aa  51.2  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4543  hypothetical protein  35.05 
 
 
136 aa  49.3  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1943  hypothetical protein  37.62 
 
 
144 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000376833 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12090  hypothetical protein  40 
 
 
138 aa  44.7  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0468866  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1060  hypothetical protein  33.33 
 
 
121 aa  42.7  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>