26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2924 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2924  CGLD9; hypothetical protein  100 
 
 
118 aa  212  9.999999999999999e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000992549  hitchhiker  0.0000308384 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0350  hypothetical protein  49.22 
 
 
146 aa  102  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0459  putative transmembrane protein  52.25 
 
 
129 aa  100  8e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.647945 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0167  putative transmembrane protein  52.38 
 
 
127 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0176  putative transmembrane protein  52.38 
 
 
127 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0157  putative transmembrane protein  52.38 
 
 
127 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0193  putative transmembrane protein  52.68 
 
 
148 aa  87.4  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.580354  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10406  transmembrane protein  54.46 
 
 
123 aa  87.4  6e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4484  hypothetical protein  42.48 
 
 
137 aa  83.2  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.38663  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3725  hypothetical protein  52.88 
 
 
127 aa  81.3  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2206  hypothetical protein  44.23 
 
 
138 aa  77.4  0.00000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00274639  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3912  putative transmembrane protein  41.82 
 
 
127 aa  69.3  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.116991  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25040  hypothetical protein  42.86 
 
 
144 aa  68.2  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13960  hypothetical protein  40 
 
 
132 aa  61.6  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.735929 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0794  hypothetical protein  40.91 
 
 
123 aa  61.2  0.000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.332572  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0483  hypothetical protein  41.12 
 
 
124 aa  60.8  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0888  hypothetical protein  41.51 
 
 
129 aa  59.7  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1943  hypothetical protein  41.28 
 
 
144 aa  57.8  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000376833 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4543  hypothetical protein  42.06 
 
 
136 aa  52.8  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2784  hypothetical protein  45.05 
 
 
144 aa  52  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0289  hypothetical protein  38.52 
 
 
141 aa  50.8  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.723479  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2730  putative transmembrane protein  45.63 
 
 
138 aa  50.1  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137333  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3780  hypothetical protein  33.04 
 
 
139 aa  47.4  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00228572  normal  0.0675277 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22010  hypothetical protein  42.45 
 
 
142 aa  47  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.186895  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12090  hypothetical protein  40.71 
 
 
138 aa  45.1  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0468866  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1060  hypothetical protein  42.68 
 
 
121 aa  43.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>