23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0289 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0289  hypothetical protein  100 
 
 		 141 aa  268  2e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.723479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0246  hypothetical protein  78.57 
 
 		 140 aa  198  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0417103 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3780  hypothetical protein  41.18 
 
 		 139 aa  97.4  6e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00228572  normal  0.0675277 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0051  hypothetical protein  40 
 
 		 139 aa  80.1  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45766  predicted protein  41.07 
 
 		 201 aa  67.4  0.00000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455794  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15399  predicted protein  39.66 
 
 		 176 aa  63.9  0.0000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.581313  normal  0.681508 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2033  hypothetical protein  32.31 
 
 		 136 aa  63.5  0.0000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.127382  normal  0.305601 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0350  hypothetical protein  31.11 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2784  hypothetical protein  29.86 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2924  CGLD9; hypothetical protein  38.52 
 
 		 118 aa  50.8  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000992549  hitchhiker  0.0000308384 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2057  hypothetical protein  33.85 
 
 		 143 aa  50.4  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0404  hypothetical protein  33.08 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0600  hypothetical protein  34.31 
 
 		 138 aa  46.2  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.367225  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0459  putative transmembrane protein  34.75 
 
 		 129 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.647945 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2509  hypothetical protein  32.76 
 
 		 144 aa  44.7  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.458827  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1772  hypothetical protein  28.33 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.019002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0167  putative transmembrane protein  34.82 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3912  putative transmembrane protein  33.91 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.116991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0157  putative transmembrane protein  34.82 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0176  putative transmembrane protein  34.82 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3725  hypothetical protein  35.14 
 
 		 127 aa  40.8  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0193  putative transmembrane protein  34.01 
 
 		 148 aa  40.8  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.580354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10406  transmembrane protein  31.15 
 
 		 123 aa  40.4  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>