26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3912 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3912  putative transmembrane protein  100 
 
 		 127 aa  238  2e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.116991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0459  putative transmembrane protein  53.28 
 
 		 129 aa  118  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.647945 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3725  hypothetical protein  51.4 
 
 		 127 aa  101  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0167  putative transmembrane protein  48.62 
 
 		 127 aa  100  8e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0176  putative transmembrane protein  48.62 
 
 		 127 aa  100  8e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0483  hypothetical protein  54.46 
 
 		 124 aa  100  8e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0157  putative transmembrane protein  48.62 
 
 		 127 aa  100  9e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0193  putative transmembrane protein  50.43 
 
 		 148 aa  90.9  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.580354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10406  transmembrane protein  43.1 
 
 		 123 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22010  hypothetical protein  48.74 
 
 		 142 aa  80.5  0.000000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.186895  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2206  hypothetical protein  39.82 
 
 		 138 aa  79  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00274639  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0350  hypothetical protein  42.06 
 
 		 146 aa  77.4  0.00000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4543  hypothetical protein  46.02 
 
 		 136 aa  76.3  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2924  CGLD9; hypothetical protein  41.88 
 
 		 118 aa  72.4  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000992549  hitchhiker  0.0000308384 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25040  hypothetical protein  38.52 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4484  hypothetical protein  35.34 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.38663  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13960  hypothetical protein  41.67 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.735929 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1060  hypothetical protein  48.72 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1943  hypothetical protein  33.33 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000376833 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0794  hypothetical protein  38.54 
 
 		 123 aa  57  0.00000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.332572  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0888  hypothetical protein  32.77 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2730  putative transmembrane protein  43.88 
 
 		 138 aa  52.8  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137333  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12090  hypothetical protein  40.5 
 
 		 138 aa  47  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0468866  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0289  hypothetical protein  34.17 
 
 		 141 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.723479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1772  hypothetical protein  33.62 
 
 		 129 aa  40.8  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.019002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15399  predicted protein  35.96 
 
 		 176 aa  40.4  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.581313  normal  0.681508 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>