25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_22010 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_22010  hypothetical protein  100 
 
 
142 aa  272  1.0000000000000001e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.186895  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3912  putative transmembrane protein  48.15 
 
 
127 aa  95.9  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.116991  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0157  putative transmembrane protein  44.04 
 
 
127 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0167  putative transmembrane protein  43.12 
 
 
127 aa  81.3  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0176  putative transmembrane protein  43.12 
 
 
127 aa  81.3  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0459  putative transmembrane protein  38.46 
 
 
129 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.647945 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0483  hypothetical protein  47.52 
 
 
124 aa  77  0.00000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3725  hypothetical protein  41.53 
 
 
127 aa  76.6  0.00000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0193  putative transmembrane protein  40.5 
 
 
148 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.580354  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10406  transmembrane protein  42.99 
 
 
123 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0350  hypothetical protein  37.59 
 
 
146 aa  70.1  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2924  CGLD9; hypothetical protein  42.61 
 
 
118 aa  65.5  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000992549  hitchhiker  0.0000308384 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2206  hypothetical protein  34.23 
 
 
138 aa  62.4  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00274639  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25040  hypothetical protein  33.33 
 
 
144 aa  57.8  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4543  hypothetical protein  37.72 
 
 
136 aa  57  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2730  putative transmembrane protein  47.17 
 
 
138 aa  53.9  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137333  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1060  hypothetical protein  42.68 
 
 
121 aa  53.5  0.0000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12090  hypothetical protein  45.16 
 
 
138 aa  53.1  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0468866  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0794  hypothetical protein  37.65 
 
 
123 aa  48.9  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.332572  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1943  hypothetical protein  35.45 
 
 
144 aa  47  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000376833 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4484  hypothetical protein  28.44 
 
 
137 aa  45.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.38663  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0888  hypothetical protein  27.27 
 
 
129 aa  43.9  0.0008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13960  hypothetical protein  36.36 
 
 
132 aa  43.5  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.735929 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1772  hypothetical protein  30.77 
 
 
129 aa  43.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.019002  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2784  hypothetical protein  34.23 
 
 
144 aa  40.4  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>