23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4484 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4484  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  272  9e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.38663  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0350  hypothetical protein  47.37 
 
 		 146 aa  116  9e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0459  putative transmembrane protein  40.83 
 
 		 129 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.647945 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2924  CGLD9; hypothetical protein  43.65 
 
 		 118 aa  94.7  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000992549  hitchhiker  0.0000308384 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0167  putative transmembrane protein  41.8 
 
 		 127 aa  94.4  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0176  putative transmembrane protein  41.8 
 
 		 127 aa  94.4  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0157  putative transmembrane protein  40.98 
 
 		 127 aa  92  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10406  transmembrane protein  39.32 
 
 		 123 aa  84  7e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0794  hypothetical protein  43.55 
 
 		 123 aa  81.6  0.000000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.332572  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0193  putative transmembrane protein  41.13 
 
 		 148 aa  80.5  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.580354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3725  hypothetical protein  40 
 
 		 127 aa  79.7  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2206  hypothetical protein  39.83 
 
 		 138 aa  73.2  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00274639  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25040  hypothetical protein  34.4 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3912  putative transmembrane protein  37.07 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.116991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13960  hypothetical protein  37.9 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.735929 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0483  hypothetical protein  35.09 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0888  hypothetical protein  31.25 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4543  hypothetical protein  32.14 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1060  hypothetical protein  33.33 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2730  putative transmembrane protein  31.48 
 
 		 138 aa  47.8  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1943  hypothetical protein  34.48 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000376833 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3780  hypothetical protein  30.77 
 
 		 139 aa  41.6  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00228572  normal  0.0675277 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15399  predicted protein  30.58 
 
 		 176 aa  41.6  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.581313  normal  0.681508 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>