20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4543 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4543  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  258  1e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25040  hypothetical protein  45.53 
 
 		 144 aa  86.7  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3912  putative transmembrane protein  43.12 
 
 		 127 aa  72  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.116991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0459  putative transmembrane protein  43.93 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.647945 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0193  putative transmembrane protein  43.09 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.580354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2206  hypothetical protein  39.83 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00274639  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0483  hypothetical protein  44.04 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3725  hypothetical protein  42.28 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0157  putative transmembrane protein  40.2 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0167  putative transmembrane protein  39.22 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0176  putative transmembrane protein  39.22 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10406  transmembrane protein  41.18 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1060  hypothetical protein  50 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2924  CGLD9; hypothetical protein  42.86 
 
 		 118 aa  53.9  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000992549  hitchhiker  0.0000308384 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4484  hypothetical protein  30.91 
 
 		 137 aa  50.4  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.38663  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0794  hypothetical protein  35.05 
 
 		 123 aa  50.1  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.332572  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0350  hypothetical protein  33.59 
 
 		 146 aa  48.9  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22010  hypothetical protein  39.39 
 
 		 142 aa  47.4  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.186895  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13960  hypothetical protein  37.36 
 
 		 132 aa  45.1  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.735929 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0888  hypothetical protein  26.19 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>